RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596351.5

LTBP4-215, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 512 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-215	ENST00000596351	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351		H3BRB1	525 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	TLL1	O43897	1013 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	ICAM3	P32942	547 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	TMEM87B	Q96K49	555 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		13.93	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	TREH	O43280	583 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	FIBP	O43427	364 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	THPO	P40225	353 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	UBE2S	Q16763	222 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	CUL5	Q93034	780 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	GPR20	Q99678	358 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	MTA3	Q9BTC8	594 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.92	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	KIF28P	B7ZC32	967 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	LGR5	O75473	907 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	STAM2	O75886	525 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	CTSH	P09668	335 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	HOXC8	P31273	242 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	LIFR	P42702	1097 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	GNAQ	P50148	359 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	TFF2	Q03403	129 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	NEDD9	Q14511	834 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.91	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	RSPH10B	P0C881	870 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	CALM1	P0DP23	149 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	CALM2	P0DP24	149 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	CALM3	P0DP25	149 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	GRB10	Q13322	594 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	TMTC2	Q8N394	836 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		13.9	□□□□□ -0.18
LTBP4-215	ENST00000596351	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.9	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	LPXN	O60711	386 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	ATP9A	O75110	1047 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	GJB5	O95377	273 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	IKBKE	Q14164	716 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	EMSY	Q7Z589	1322 aa		13.89	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	KCNA2	P16389	499 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	ITGB5	P18084	799 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	ARHGAP4	P98171	946 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.88	□□□□□ -0.19
LTBP4-215	ENST00000596351	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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