RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.74■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.74■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 GPR20Q99678 358 aa22.74■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.74■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.74■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.74■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 CYP2C9P11712 490 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 GNA11P29992 359 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 CHMP4BP1P59074 171 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 MCTP2Q6DN12 878 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM199Q8N511 208 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 DEXIO95424 95 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 LGALS2P05162 132 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 CSF2RAP15509 400 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 ARHGAP4P98171 946 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.232e-8■■■□□ 19.1
EFTUD2-217ENST00000590124 CEP55Q53EZ4 464 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 LRCH3Q96II8 777 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 ALG1Q9BT22 464 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.72■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 MEIS1O00470 390 aa22.71■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 CYP3A4P08684 503 aa22.71■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 NEK4P51957 841 aa22.71■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 BICD2Q8TD16 824 aa22.71■■□□□ 1.23
EFTUD2-217ENST00000590124 H3BRB1 525 aa22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 ARP10275 920 aa22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 PTGISQ16647 500 aa22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 C7orf31Q8N865 590 aa22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 AIFM3Q96NN9 605 aa22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 LAMA3Q16787 3333 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 TANC1Q9C0D5 1861 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 STK36Q9NRP7 1315 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 CDKL5O76039 1030 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 LARGE1O95461 756 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 CTDNEP1O95476 244 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 CCL23P55773 120 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 HIC1Q14526 733 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 ME3Q16798 604 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 VWCEQ96DN2 955 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.229e-10■■□□□ 11.6
EFTUD2-217ENST00000590124 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.69■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 NFASCO94856 1347 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM86B1E9PN63 330 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 PITPNM1O00562 1244 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 HOXC8P31273 242 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 NLRP5P59047 1200 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 SP4Q02446 784 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 NPY5RQ15761 445 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM240Q5SV17 173 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 TRIM50Q86XT4 487 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF2CQ99661 725 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 IL23AQ9NPF7 189 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 NOD1Q9Y239 953 aa22.68■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 M0R2N6 131 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 GPR153Q6NV75 609 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 GTF3C6Q969F1 213 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 SCLYQ96I15 445 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.67■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 SCN5AQ14524 2016 aa22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 EDIL3O43854 480 aa22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 ACRP10323 421 aa22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF76P36508 570 aa22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 RBL2Q08999 1139 aa22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 RASIP1Q5U651 963 aa22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 NECAB1Q8N987 351 aa22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 DTNBO60941 627 aa22.65■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.65■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.65■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 CIITAP33076 1130 aa22.65■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
EFTUD2-217ENST00000590124 BFSP2Q13515 415 aa22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms