RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 CEP55Q53EZ4 464 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 RETREG2Q8NC44 543 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 KAT2BQ92831 832 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 CYP2C9P11712 490 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 SREBF1P36956 1147 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 IL17RAQ96F46 866 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 GPR20Q99678 358 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 SDF4Q9BRK5 362 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.55■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 H3BRB1 525 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 ATP9AO75110 1047 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 F2P00734 622 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 CCL23P55773 120 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 SHHQ15465 462 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 WASF1Q92558 559 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 LGALS2P05162 132 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 CSF2RAP15509 400 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 BFSP2Q13515 415 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 SESTD1Q86VW0 696 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 KCNA2P16389 499 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 GALNT17Q6IS24 598 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 NECAB1Q8N987 351 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.52■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 HAS3O00219 553 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 MEIS1O00470 390 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ARP10275 920 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ME3Q16798 604 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 GLG1Q92896 1179 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.51■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 CYP3A4P08684 503 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ACRP10323 421 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 GNAT1P11488 350 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 BLIDQ8IZY5 108 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 AZI2Q9H6S1 392 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 IL23AQ9NPF7 189 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 STK36Q9NRP7 1315 aa21.5■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 EPHB4P54760 987 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 GTF3C6Q969F1 213 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 AIFM3Q96NN9 605 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 LTBP2Q14767 1821 aa21.49■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 FAM86B1E9PN63 330 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ADAMTS3O15072 1205 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 FGBP02675 491 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 PRR16Q569H4 304 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 CAGE1Q8TC20 777 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 SCLYQ96I15 445 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 NFASCO94856 1347 aa21.48■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 PITPNM1O00562 1244 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 USP11P51784 963 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 PTK7Q13308 1070 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 TRIM29Q14134 588 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF365Q70YC5 407 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 TRIM50Q86XT4 487 aa21.47■■□□□ 1.03
GIPC1-210ENST00000589497 LRCH3Q96II8 777 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms