RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CCNA1P78396 465 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 DEFB103AP81534 67 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 STK38Q15208 465 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CCDC102BQ68D86 513 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 KANK3Q6NY19 840 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FERMT3Q86UX7 667 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SPATA5Q8NB90 893 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 NAPBQ9H115 298 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.19□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 USP17L5A8MUK1 530 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 M0R2C6 588 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ZBTB43O43298 467 aa9.18□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 ZAP70P43403 619 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CLCN5P51795 746 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ARHGAP8P85298 464 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 APOBRQ0VD83 1088 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SEMA3FQ13275 785 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 UBE4AQ14139 1066 aa9.18□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 POTEDQ86YR6 584 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 WDR18Q9BV38 432 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.18□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 CCDC69A6NI79 296 aa9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SPTLC2O15270 562 aa9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CBFA2T2O43439 604 aa9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 JAK2O60674 1132 aa9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 AKR1A1P14550 325 aa9.17□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.17□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 KCND1Q9NSA2 647 aa9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 USP40Q9NVE5 1235 aa9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 FAM13BQ9NYF5 915 aa9.17□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.17□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.17□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 IKBKBO14920 756 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ENTPD3O75355 529 aa9.16□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 ACTN1P12814 892 aa9.16□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 NPR3P17342 541 aa9.16□□□□□ -0.94
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GGA3-218ENST00000584243 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 CAP2P40123 477 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 LMNB2Q03252 620 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SLC39A14Q15043 492 aa9.16□□□□□ -0.94
GGA3-218ENST00000584243 SYCP1Q15431 976 aa9.16□□□□□ -0.94
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