RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARNTL2Q8WYA1 636 aa32.52■■■□□ 2.8
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZBED2Q9BTP6 218 aa32.52■■■□□ 2.8
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PIK3CDO00329 1044 aa32.51■■■□□ 2.79
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CALM1P0DP23 149 aa32.51■■■□□ 2.79
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CALM2P0DP24 149 aa32.51■■■□□ 2.79
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CALM3P0DP25 149 aa32.51■■■□□ 2.79
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa32.5■■■□□ 2.79
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa32.5■■■□□ 2.79
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRRC2Q9BYS8 371 aa32.5■■■□□ 2.79
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa32.48■■■□□ 2.79
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa32.47■■■□□ 2.79
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LGR5O75473 907 aa32.47■■■□□ 2.79
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SETD4Q9NVD3 440 aa32.44■■■□□ 2.78
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRT40Q6A162 431 aa32.43■■■□□ 2.78
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa32.43■■■□□ 2.78
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TNFRSF10AO00220 468 aa32.41■■■□□ 2.78
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDHR1Q96JP9 859 aa32.41■■■□□ 2.78
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP32.4■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NEK1Q96PY6 1258 aa32.4■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CAND2O75155 1236 aa32.39■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AMHP03971 560 aa32.39■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ITGB5P18084 799 aa32.39■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGAP4P98171 946 aa32.39■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa32.39■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MTUS1Q9ULD2 1270 aa32.39■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KAT6AQ92794 2004 aa32.39■■■□□ 2.78
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATP9AO75110 1047 aa32.38■■■□□ 2.77
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCNA2P16389 499 aa32.38■■■□□ 2.77
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