RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.25■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM126BQ8IXS8 530 aa25.25■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.25■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.25■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.25■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.25■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM86B1E9PN63 330 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 F2P00734 622 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SYN1P17600 705 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM29Q14134 588 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCAS3Q9H6U6 928 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.24■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NFASCO94856 1347 aa25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF286BP0CG31 522 aa25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARP10275 920 aa25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 USP11P51784 963 aa25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.634e-7■■■■□ 24.9
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBCKQ8TEA7 893 aa25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPR20Q99678 358 aa25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SDF4Q9BRK5 362 aa25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.22■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT2P35908 639 aa25.22■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAAP100Q0VG06 881 aa25.22■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NBPF20Q3BBV1 942 aa25.22■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KAT2BQ92831 832 aa25.22■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMX3Q96JJ7 454 aa25.22■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LTBP2Q14767 1821 aa25.21■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SP4Q02446 784 aa25.21■■□□□ 1.63
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HAS3O00219 553 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA0355O15063 1070 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD4P01730 458 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MMP1P03956 469 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LGALS2P05162 132 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSEN2P49810 448 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MFSD10Q14728 455 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBX21Q9UL17 535 aa25.2■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EDIL3O43854 480 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRR16Q569H4 304 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT40Q6A162 431 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SESTD1Q86VW0 696 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OXER1Q8TDS5 423 aa25.19■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 B4GALT4O60513 344 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FOSBP53539 338 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHMP4BP1P59074 171 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INF2Q27J81 1249 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LENG9Q96B70 501 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C8orf76Q96K31 380 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF577Q9BSK1 485 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF3AQ9Y496 699 aa25.18■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 H3BRB1 525 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYP3A7P24462 503 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEK8Q86SG6 692 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GDF15Q99988 308 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP290O15078 2479 aa25.17■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAG1P15918 1043 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NR5A1Q13285 461 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 Q4G0T1 1027 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C7orf31Q8N865 590 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TNFRSF25Q93038 417 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MBOAT7Q96N66 472 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.16■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EMSYQ7Z589 1322 aa25.15■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.15■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TDP2O95551 362 aa25.15■■□□□ 1.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms