RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561952.1

GINS3-204, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene GINS3, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-204ENST00000561952 TMEM87BQ96K49 555 aa9.51□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.51□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.51□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 MAF1Q9H063 256 aa9.51□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CERS4Q9HA82 394 aa9.51□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.51□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 KAT6AQ92794 2004 aa9.51□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 REV3LO60673 3130 aa9.51□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CDC45O75419 566 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 F2P00734 622 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 ACTN1P12814 892 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 GNAQP50148 359 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 GNPTABQ3T906 1256 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 RNF20Q5VTR2 975 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 TRIM50Q86XT4 487 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 WNT8BQ93098 351 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CCDC136Q96JN2 1154 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 NEK1Q96PY6 1258 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.5□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 LGALS2P05162 132 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CA3P07451 260 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 PFKMP08237 780 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CALM1P0DP23 149 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CALM2P0DP24 149 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CALM3P0DP25 149 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CKBP12277 381 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CPA1P15085 419 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 RFC2P35250 354 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 FGD1P98174 961 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SEMA3FQ13275 785 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 HIC1Q14526 733 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 TMTC2Q8N394 836 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CAGE1Q8TC20 777 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 PGBD1Q96JS3 809 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 MAP3K14Q99558 947 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 LZTS2Q9BRK4 669 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.49□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 HAS3O00219 553 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 RFXAPO00287 272 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 MEIS2O14770 477 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 FIBPO43427 364 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 CTSHP09668 335 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SELPP16109 830 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 THPOP40225 353 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 LIFRP42702 1097 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 KCNJ6P48051 423 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 ADGRE1Q14246 886 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 RTN1Q16799 776 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 TCTN1Q2MV58 587 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 APOA5Q6Q788 366 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SESTD1Q86VW0 696 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 FANCBQ8NB91 859 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.48□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 FAM205CA6NFA0 338 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 H3BRB1 525 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 TREHO43280 583 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 ZBTB43O43298 467 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 NBNO60934 754 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 PPFIA3O75145 1194 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 PPFIA4O75335 1185 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 ARHGEF15O94989 841 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.47□□□□□ -0.89
GINS3-204ENST00000561952 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms