RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 DDIT3P35638 169 aa24.02■■□□□ 1.44
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MEIS3-212ENST00000561293 FERMT2Q96AC1 680 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 CLIC4Q9Y696 253 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 DHX15O43143 795 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 SGPL1O95470 568 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 Q4G0T1 1027 aa24.02■■□□□ 1.44
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MEIS3-212ENST00000561293 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 TRIM50Q86XT4 487 aa24.02■■□□□ 1.44
MEIS3-212ENST00000561293 MBOAT7Q96N66 472 aa24.02■■□□□ 1.44
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MEIS3-212ENST00000561293 CCNE2O96020 404 aa24.01■■□□□ 1.43
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MEIS3-212ENST00000561293 TGFB3P10600 412 aa24■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 TXKP42681 527 aa24■■□□□ 1.43
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MEIS3-212ENST00000561293 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.99■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 CXCL17Q6UXB2 119 aa23.99■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 BRAPQ7Z569 592 aa23.99■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 USP28Q96RU2 1077 aa23.99■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
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MEIS3-212ENST00000561293 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.98■■□□□ 1.43
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MEIS3-212ENST00000561293 MMP3P08254 477 aa23.98■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 MYL3P08590 195 aa23.98■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 NEDD9Q14511 834 aa23.98■■□□□ 1.43
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MEIS3-212ENST00000561293 MOXD1Q6UVY6 613 aa23.97■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.97■■□□□ 1.43
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MEIS3-212ENST00000561293 SLC9A2Q9UBY0 812 aa23.97■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 ASGR1P07306 291 aa23.96■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 IL17AQ16552 155 aa23.96■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 MTMR9Q96QG7 549 aa23.96■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 GPR20Q99678 358 aa23.96■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.96■■□□□ 1.43
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MEIS3-212ENST00000561293 MAFGO15525 162 aa23.96■■□□□ 1.43
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MEIS3-212ENST00000561293 ACTR2P61160 394 aa23.96■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 GRIN1Q05586 938 aa23.96■■□□□ 1.43
MEIS3-212ENST00000561293 LAMC2Q13753 1193 aa23.96■■□□□ 1.43
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MEIS3-212ENST00000561293 TECP42680 631 aa23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 RNF180Q86T96 592 aa23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 PPTC7Q8NI37 304 aa23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 SPC25Q9HBM1 224 aa23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 VAV3Q9UKW4 847 aa23.95■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 MARK3P27448 753 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 CDC25AP30304 524 aa23.94■■□□□ 1.42
MEIS3-212ENST00000561293 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
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