RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559898.5

HDDC3-205, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,024 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-205ENST00000559898 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.41■□□□□ 0.86
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HDDC3-205ENST00000559898 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.38■□□□□ 0.85
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HDDC3-205ENST00000559898 HOXC8P31273 242 aa20.37■□□□□ 0.85
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HDDC3-205ENST00000559898 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.35■□□□□ 0.85
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HDDC3-205ENST00000559898 JADE2Q9NQC1 790 aa20.34■□□□□ 0.85
HDDC3-205ENST00000559898 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.34■□□□□ 0.85
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HDDC3-205ENST00000559898 ARP10275 920 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-205ENST00000559898 RPS6KB1P23443 525 aa20.33■□□□□ 0.85
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HDDC3-205ENST00000559898 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-205ENST00000559898 ADAM17P78536 824 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-205ENST00000559898 PKN1Q16512 942 aa20.33■□□□□ 0.85
HDDC3-205ENST00000559898 KRT40Q6A162 431 aa20.33■□□□□ 0.85
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HDDC3-205ENST00000559898 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
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