RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 IL31RAQ8NI17 732 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 RAET1EQ8TD07 263 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FGD4Q96M96 766 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 USP25Q9UHP3 1055 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PCDHA7Q9UN72 937 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 Q9Y3F1 56 aa10.5□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 VWA3AA6NCI4 1184 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 EDIL3O43854 480 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PSMD10O75832 226 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 IGHA2P01877 340 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ACVR2BQ13705 512 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 LAMC2Q13753 1193 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 NBR1Q14596 966 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SEPT14Q6ZU15 432 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 OTOP1Q7RTM1 612 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 HAS1Q92839 578 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CALML4Q96GE6 196 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CCSER1Q9C0I3 900 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 NT5C3AQ9H0P0 336 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ASTN1O14525 1302 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa10.49□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 WDR64B1ANS9 1081 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ADCY3O60266 1144 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MSCO60682 206 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 HMGCRP04035 888 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ARP10275 920 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TXNP10599 105 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CAPN2P17655 700 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TECP42680 631 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PRKCZQ05513 592 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 DUSP28Q4G0W2 176 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 RESP18Q5W5W9 173 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 KANK3Q6NY19 840 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 METTL7BQ6UX53 244 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ANP32EQ9BTT0 268 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 LRRC27Q9C0I9 530 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TMEM60Q9H2L4 133 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CUEDC2Q9H467 287 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MLXIPQ9HAP2 919 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MAGEF1Q9HAY2 307 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 SLC9A2Q9UBY0 812 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 WNT7AO00755 349 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 DHX15O43143 795 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 RGS20O76081 388 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 GH1P01241 217 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PSAPP07602 524 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 AKR1A1P14550 325 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 KCNA2P16389 499 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CTGFP29279 349 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 FAM160A1Q05DH4 1040 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 EPHA7Q15375 998 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CCDC62Q6P9F0 684 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 MIER3Q7Z3K6 550 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 IQUBQ8NA54 791 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 RASSF8Q8NHQ8 419 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 CSRNP2Q9H175 543 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 GDPD2Q9HCC8 539 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 TUFT1Q9NNX1 390 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 VAV3Q9UKW4 847 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa10.47□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 WDR81Q562E7 1941 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 NOP56O00567 594 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 KPNA6O60684 536 aa10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 P4HBP07237 508 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
CS-220ENST00000550700 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms