RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548025.5

MARF1-205, Transcript of meiosis regulator and mRNA stability factor 1, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MARF1, Length 5,891 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MARF1-205	ENST00000548025	APOE	P02649	317 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	PPIL2	Q13356	520 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	MTR	Q99707	1265 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	THPO	P40225	353 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	RPTOR	Q8N122	1335 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	CYP27B1	O15528	508 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	HMGCR	P04035	888 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	GCK	P35557	465 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	MAP2K2	P36507	400 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	ITIH3	Q06033	890 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	COG7	P83436	770 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	TYRO3	Q06418	890 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	ACCSL	Q4AC99	568 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	IQCD	Q96DY2	449 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	UTY	O14607	1347 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025		K7ERI5	159 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	RNF8	O76064	485 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	GRK4	P32298	578 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	PHKA1	P46020	1223 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
MARF1-205	ENST00000548025	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.65	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	FIBCD1	Q8N539	461 aa		11.65	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.65	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.65	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		11.65	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	RAB27A	P51159	221 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	EPHB3	P54753	998 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	FBXW4	P57775	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	PEX6	Q13608	980 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SPOP	O43791	374 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	ZWINT	O95229	277 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SCG2	P13521	617 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SPTLC2	O15270	562 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	BNIP3L	O60238	219 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	POMC	P01189	267 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SPACA7	Q96KW9	195 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	CTSH	P09668	335 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	EFNA5	P52803	228 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	KLRC2	P26717	231 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	KRT83	P78385	493 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	LGSN	Q5TDP6	509 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	SHD	Q96IW2	340 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	TLL1	O43897	1013 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	GJB1	P08034	283 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	CYP2C9	P11712	490 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025		A0A1W2PRG0	241 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	FGB	P02675	491 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MARF1-205	ENST00000548025	GYS1	P13807	737 aa		11.62	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms