RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538758.1

RIMKLB-208, Transcript of ribosomal modification protein rimK like family member B, human

TSL 3

Gene RIMKLB, Length 570 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RIMKLB-208	ENST00000538758	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	KPNA6	O60684	536 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PPFIA4	O75335	1185 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	MMP3	P08254	477 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	MYL3	P08590	195 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	CYP3A7	P24462	503 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	GJB2	P29033	226 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PPTC7	Q8NI37	304 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SPATA33	Q96N06	139 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	UIMC1	Q96RL1	719 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ELP1	O95163	1332 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	CABYR	O75952	493 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	CDK7	P50613	346 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PSMC6	P62333	389 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SNX17	Q15036	470 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	DGKD	Q16760	1214 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758		Q4G0T1	1027 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PRR16	Q569H4	304 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	METTL7B	Q6UX53	244 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	KAT2B	Q92831	832 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	LENG9	Q96B70	501 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	MBOAT7	Q96N66	472 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	GPR20	Q99678	358 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	NFASC	O94856	1347 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ARVCF	O00192	962 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	MSH4	O15457	936 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	TDP2	O95551	362 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	RTP1	P59025	263 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	LETM2	Q2VYF4	491 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	NEK8	Q86SG6	692 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	KIF28P	B7ZC32	967 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	EVI5	O60447	810 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ATG7	O95352	703 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SP4	Q02446	784 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	TLE2	Q04725	743 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	TRIM60	Q495X7	471 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	GJA10	Q969M2	543 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SDF4	Q9BRK5	362 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	KIF3A	Q9Y496	699 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ALPK3	Q96L96	1907 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	HAS3	O00219	553 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	WNT7A	O00755	349 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SLC37A4	O43826	429 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	LGALS2	P05162	132 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ZNF286B	P0CG31	522 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	PSEN2	P49810	448 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	HSCB	Q8IWL3	235 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RIMKLB-208	ENST00000538758	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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