RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	SULT2A1	Q06520	285 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SMUG1	Q53HV7	270 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	KRT12	Q99456	494 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	PNMA2	Q9UL42	364 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SEMA3E	O15041	775 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	PYGM	P11217	842 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	IDO1	P14902	403 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	GNAT2	P19087	354 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CD97	P48960	835 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	MTTP	P55157	894 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	RASSF7	Q02833	373 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	PTPA	Q15257	358 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR59	Q6PJI9	974 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	NEK9	Q8TD19	979 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF333	Q96JL9	665 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CATSPER2	Q96P56	530 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	MTFR1L	Q9H019	292 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	MIS12	Q9H081	205 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	AKR1B10	O60218	316 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	IFNAR2	P48551	515 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	HPCA	P84074	193 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	STKLD1	Q8NE28	680 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	NELFB	Q8WX92	580 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CROT	Q9UKG9	612 aa		8.58	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351		A0A0G2JS52	829 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP9B	O43861	1147 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SNX3	O60493	162 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ZPR1	O75312	459 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	DNA2	P51530	1060 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CENPK	Q9BS16	269 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	RAD21	O60216	631 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	GM2A	P17900	193 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	NFKBIA	P25963	317 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SERPINB3	P29508	390 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	MECOM	Q03112	1051 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	TEF	Q10587	303 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC39A6	Q13433	755 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ITGA7	Q13683	1181 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC6	Q16204	474 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	USH1G	Q495M9	461 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	KLC3	Q6P597	504 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	DNAJC7	Q99615	494 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ITM2B	Q9Y287	266 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		8.57	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	SMIM23	A6NLE4	172 aa		8.56	□□□□□ -1.04
ZNF438-208	ENST00000538351	MAGEB3	O15480	346 aa		8.56	□□□□□ -1.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms