RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 CCDC89Q8N998 374 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 MAIP1Q8WWC4 291 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CDHR1Q96JP9 859 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 MTA3Q9BTC8 594 aa11□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 POTEMA6NI47 508 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 FAM160B1Q5W0V3 765 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 C10orf67Q8IYJ2 551 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 PARVGQ9HBI0 331 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 KMT5AQ9NQR1 393 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 STIM2Q9P246 746 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 RWDD2AQ9UIY3 292 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 STK36Q9NRP7 1315 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 AFPP02771 609 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CDC25BP30305 580 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CCNA1P78396 465 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 MESDQ14696 234 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 LLGL1Q15334 1064 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CFAP157Q5JU67 520 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CEP57Q86XR8 500 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 WDR19Q8NEZ3 1342 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 MYO1FO00160 1098 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 MTERF2Q49AM1 385 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 SGMS1Q86VZ5 419 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 ACRBPQ8NEB7 543 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CEP63Q96MT8 703 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 SALL3Q9BXA9 1300 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 ZBTB5O15062 677 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 ZBED6P86452 979 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 RESP18Q5W5W9 173 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CROCCP2Q86T23 111 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 VSTM4Q8IW00 320 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CTAGE3PQ8IX95 158 aa10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 TSGA10IPQ3SY00 556 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 DENND2CQ68D51 928 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 PDXDC2PQ6P474 469 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CCDC125Q86Z20 511 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 APOL6Q9BWW8 343 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 NDST4Q9H3R1 872 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 PIM2Q9P1W9 311 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 F5H6K3 240 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 RNF8O76064 485 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 ZBTB7AO95365 584 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 TBC1D8O95759 1140 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 MXI1P50539 228 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 KLRC3Q07444 240 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 MTMR3Q13615 1198 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 ARID5BQ14865 1188 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 KRT31Q15323 416 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 PPP2R5EQ16537 467 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 ACCSQ96QU6 501 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 VPS37BQ9H9H4 285 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 SOWAHDA6NJG2 315 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 SFI1A8K8P3 1242 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 USP17L10C9JJH3 530 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 ECE2O60344 883 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 PIK3CAP42336 1068 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 GPSM2P81274 684 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CUL4BQ13620 913 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CEP85LQ5SZL2 805 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 SESTD1Q86VW0 696 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 PIGOQ8TEQ8 1089 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CABS1Q96KC9 395 aa10.98□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 BPIFB4P59827 614 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 GEN1Q17RS7 908 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 FAM133AQ8N9E0 248 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 POLD4Q9HCU8 107 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 SH3GLB2Q9NR46 395 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 SPTLC3Q9NUV7 552 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 CAPN9O14815 690 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 RCAN1P53805 252 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 MFAP3P55082 362 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 GUCY2DQ02846 1103 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 ITIH3Q06033 890 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 FAM83BQ5T0W9 1011 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 NEDD1Q8NHV4 660 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 RAB20Q9NX57 234 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 GCNT4Q9P109 453 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 GFPT2O94808 682 aa10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
GGA3-201ENST00000537686 ADCY8P40145 1251 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms