RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535811.1

PARPBP-208, Transcript of PARP1 binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene PARPBP, Length 1,465 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBP-208ENST00000535811 JAM3Q9BX67 310 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 ARVCFO00192 962 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 LRG1P02750 347 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 STAT5AP42229 794 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 GABREP78334 506 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 FAM209AQ5JX71 171 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 SYT8Q8NBV8 401 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 CXorf38Q8TB03 319 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 ALG1Q9BT22 464 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.53□□□□□ -1.36
PARPBP-208ENST00000535811 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 A0A1B0GTL3 188 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 PRRG2O14669 202 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 NAT1P18440 290 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 FAM26FQ5R3K3 315 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 CDC6Q99741 560 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 NOBOXO60393 691 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 NFIXQ14938 502 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 PROSER1Q86XN7 944 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 WRNIP1Q96S55 665 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 TMEM209Q96SK2 561 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SYT3Q9BQG1 590 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SPATA25Q9BR10 227 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.51□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 KCNQ2O43526 872 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 GNAT1P11488 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 ZNF28P17035 718 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 PAK1Q13153 545 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 DNAJC7Q99615 494 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 IPPKQ9H8X2 491 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 WASF3Q9UPY6 502 aa6.5□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 B8ZZF3 427 aa6.49□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SLC27A2O14975 620 aa6.49□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 C2orf27AQ580R0 203 aa6.49□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.49□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 EFCAB14O75071 495 aa6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 TUSC3Q13454 348 aa6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 KCTD1Q719H9 257 aa6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 RELTQ969Z4 430 aa6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 LNPKQ9C0E8 428 aa6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 DSEQ9UL01 958 aa6.48□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 C9orf118A6NHY6 69 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 CYP7B1O75881 506 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 FAHP16930 419 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 GJA9P57773 515 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 RTP5Q14D33 572 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 DTX3Q8N9I9 347 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 CHGBP05060 677 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 COL6A2P12110 1019 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SYN1P17600 705 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 GPR19Q15760 415 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 NFE2L2Q16236 605 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 FBXW5Q969U6 566 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 CLIC6Q96NY7 704 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 KCNJ15Q99712 375 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.47□□□□□ -1.37
PARPBP-208ENST00000535811 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PARPBP-208ENST00000535811 FIGNQ5HY92 759 aa6.46□□□□□ -1.38
PARPBP-208ENST00000535811 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.46□□□□□ -1.38
PARPBP-208ENST00000535811 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.46□□□□□ -1.38
PARPBP-208ENST00000535811 UBXN4Q92575 508 aa6.46□□□□□ -1.38
PARPBP-208ENST00000535811 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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