RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897		A0A087X0T9	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TP73	O15350	636 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SERPING1	P05155	500 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FAM228B	P0C875	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	KLRC1	P26715	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GRAP	Q13588	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PLIN2	Q99541	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897		A0A0G2JMZ2	1700 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NCAN	O14594	1321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	POTEM	A6NI47	508 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	UBA7	P41226	1012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CASP5	P51878	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	EPHA7	Q15375	998 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ASTN1	O14525	1302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CYP11B2	P19099	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SHMT1	P34896	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	GPSM2	P81274	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	HES6	Q96HZ4	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TSKS	Q9UJT2	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PHACTR2	O75167	634 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PPAT	Q06203	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DDR1	Q08345	913 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MEIS2	O14770	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	PALM	O75781	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RASSF9	O75901	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ANXA13	P27216	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	USP11	P51784	963 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	MKL1	Q969V6	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	TLCD1	Q96CP7	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	EYA3	Q99504	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTSC-208	ENST00000533897	RAD51C	O43502	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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