RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515859.5

TUSC3-213, Transcript of tumor suppressor candidate 3, human

TSL 5

Gene TUSC3, Length 1,627 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUSC3-213	ENST00000515859	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	SDF4	Q9BRK5	362 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	GJD2	Q9UKL4	321 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	NFASC	O94856	1347 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	PDILT	Q8N807	584 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	PANK2	Q9BZ23	570 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	DISC1	Q9NRI5	854 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		27.94	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	ATP9A	O75110	1047 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	KCNA2	P16389	499 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CTAGE5	O15320	804 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	TINF2	Q9BSI4	451 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	VTA1	Q9NP79	307 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859		A0A087X0B3	334 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	KRT76	Q01546	638 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	KANK3	Q6NY19	840 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CNNM3	Q8NE01	707 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	APBA2	Q99767	749 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CTGF	P29279	349 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	LONRF3	Q496Y0	759 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	DHX58	Q96C10	678 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	TRIM47	Q96LD4	638 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	TNMD	Q9H2S6	317 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	SLFN14	P0C7P3	912 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	RPA1	P27694	616 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	NEDD9	Q14511	834 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	EPHA7	Q15375	998 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	E2F4	Q16254	413 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	HYI	Q5T013	277 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	CUEDC2	Q9H467	287 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	EML1	O00423	815 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	SFN	P31947	248 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	STAT6	P42226	847 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	IRF5	Q13568	498 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	RDM1	Q8NG50	284 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	SCFD2	Q8WU76	684 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TUSC3-213	ENST00000515859	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	CHMP2A	O43633	222 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	CYP2B6	P20813	491 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	CAMK4	Q16566	473 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	NEK9	Q8TD19	979 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	GPR25	O00155	361 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	MUT	P22033	750 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	JAK3	P52333	1124 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	GRB10	Q13322	594 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	TTLL4	Q14679	1199 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	STK17A	Q9UEE5	414 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TUSC3-213	ENST00000515859	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		27.88	■■■□□ 2.05

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