RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ALAS1	P13196	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANTXR2	P58335	489 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	HPCA	P84074	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MOGS	Q13724	837 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CNTROB	Q8N137	903 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM227B	Q96M60	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159		A8MUI8	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	KRT14	P02533	472 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PEX5	P50542	639 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	APOF	Q13790	326 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ITPKC	Q96DU7	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NDN	Q99608	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SNX3	O60493	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	E2F6	O75461	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PSMA5	P28066	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTK7	Q13308	1070 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NEUROD2	Q15784	382 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SPG7	Q9UQ90	795 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	FOXN1	O15353	648 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TCEA3	O75764	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZBED1	O96006	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PTPRE	P23469	700 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	NPY5R	Q15761	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLF2	Q8IX21	1173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	LZTR1	Q8N653	840 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SLC38A9-222	ENST00000515159	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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