RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 CUL5Q93034 780 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 ATP6V0A1Q93050 837 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 LZTS2Q9BRK4 669 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 MTA3Q9BTC8 594 aa19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
HERC3-211ENST00000513325 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 MEIS2O14770 477 aa19.51■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 LGR5O75473 907 aa19.51■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 PLEKHA8P1O95397 391 aa19.51■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa19.51■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 MCM5P33992 734 aa19.51■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 TFF2Q03403 129 aa19.51■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 METTL7BQ6UX53 244 aa19.51■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 IL27Q8NEV9 243 aa19.51■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 RSPH10B2B2RC85 870 aa19.5■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 PIK3CDO00329 1044 aa19.5■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 SLC27A2O14975 620 aa19.5■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB14O75071 495 aa19.5■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 RSPH10BP0C881 870 aa19.5■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 HOXC8P31273 242 aa19.5■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 GRB10Q13322 594 aa19.5■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 PCNX4Q63HM2 1172 aa19.5■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 FAM117BQ6P1L5 589 aa19.5■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM87BQ96K49 555 aa19.5■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 GPR20Q99678 358 aa19.5■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 TELO2Q9Y4R8 837 aa19.5■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 EMSYQ7Z589 1322 aa19.5■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 TREHO43280 583 aa19.49■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 LPXNO60711 386 aa19.49■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa19.49■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa19.49■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 CREB3L3Q68CJ9 461 aa19.48■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 SETD4Q9NVD3 440 aa19.48■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 MTUS1Q9ULD2 1270 aa19.48■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa19.47■□□□□ 0.71
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HERC3-211ENST00000513325 CALM3P0DP25 149 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 BMP1P13497 986 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 KCNQ1P51787 676 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 AAK1Q2M2I8 961 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 NLRX1Q86UT6 975 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 CCDC82Q8N4S0 544 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 SENP7Q9BQF6 1050 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 LRRC2Q9BYS8 371 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 PSTPIP2Q9H939 334 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 DOCK5Q9H7D0 1870 aa19.47■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 LINC01553A4QN01 128 aa19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 CTSHP09668 335 aa19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 GNAT1P11488 350 aa19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 GDPD5Q8WTR4 605 aa19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 OSBPL7Q9BZF2 842 aa19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 ANO2Q9NQ90 1003 aa19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 SLC12A7Q9Y666 1083 aa19.46■□□□□ 0.71
HERC3-211ENST00000513325 ATP9AO75110 1047 aa19.45■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 AMHP03971 560 aa19.45■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 ERVK-21P61565 698 aa19.45■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 MYOCDQ8IZQ8 938 aa19.45■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 FANCBQ8NB91 859 aa19.45■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 REV3LO60673 3130 aa19.45■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 CAND2O75155 1236 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 ITGB5P18084 799 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP4P98171 946 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 UBE2SQ16763 222 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 TMTC3Q6ZXV5 915 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 LMBR1Q8WVP7 490 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 SEPT8Q92599 483 aa19.44■□□□□ 0.7
HERC3-211ENST00000513325 GPRASP2Q96D09 838 aa19.44■□□□□ 0.7
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