RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPA4P34932 840 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAPAP54920 295 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNB2Q92953 911 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR20Q99678 358 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EHMT1Q9H9B1 1298 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNX14Q9Y5W7 946 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C17orf102A2RUQ5 167 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 REC8O95072 547 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARNO95453 639 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBL2Q08999 1139 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q6ZUG5 572 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPRASP2Q96D09 838 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDHR1Q96JP9 859 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRDM12Q9H4Q4 367 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYO9BQ13459 2157 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TET1Q8NFU7 2136 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYOGP15173 224 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APOBRQ0VD83 1088 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FUT2Q10981 343 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HIC1Q14526 733 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DLL1O00548 723 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITGB5P18084 799 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDC27P30260 824 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RCAN1P53805 252 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP6V0A1Q93050 837 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC9A7Q96T83 725 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP9AO75110 1047 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BAIAP3O94812 1187 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADCY7P51828 1080 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTMR1Q13613 665 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPNMBQ14956 572 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF618Q5T7W0 954 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP2R2DQ66LE6 453 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRF1Q92994 677 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WNT8BQ93098 351 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PKD2L1Q9P0L9 805 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TELO2Q9Y4R8 837 aa26.72■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMCO2A6NFE2 343 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THPOP40225 353 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNJ6P48051 423 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERINC5Q86VE9 423 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM50Q86XT4 487 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNPEPQ9H4A4 650 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 JADE2Q9NQC1 790 aa26.71■■□□□ 1.87
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STXBP3O00186 592 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBNO60934 754 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNAT1P11488 350 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNA2P16389 499 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSMA5P28066 241 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BARHL2Q9NY43 387 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDH23Q9H251 3354 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0C4DFX4 3053 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF28PB7ZC32 967 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAFGO15525 162 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TREHO43280 583 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOSP01100 380 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CXCL10P02778 98 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPS6KB1P23443 525 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TEX2Q8IWB9 1127 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PGBD1Q96JS3 809 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SETD4Q9NVD3 440 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHD9Q3L8U1 2897 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HERC6Q8IVU3 1022 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEPT1Q8WYJ6 367 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MXRA8Q9BRK3 442 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSPH10B2B2RC85 870 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CA3P07451 260 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSPH10BP0C881 870 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGFBP4P22692 258 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXC8P31273 242 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANO3Q9BYT9 981 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM260Q9NX78 707 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KAT6AQ92794 2004 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR5P61964 334 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms