RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ITGA4P13612 1032 aa13.07□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CALML3P27482 149 aa13.07□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 GYG1P46976 350 aa13.07□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.07□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ECT2Q9H8V3 914 aa13.07□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ABCA3Q99758 1704 aa13.07□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 MRC1P22897 1456 aa13.07□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 A0A1W2PQC6 194 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CCT8L1PA6NM43 557 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 PDE8BO95263 885 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 FGGP02679 453 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 TXNRD1Q16881 649 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 HOOK3Q86VS8 718 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 FMO2Q99518 471 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 PANK4Q9NVE7 773 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 PAPPAQ13219 1627 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CAND2O75155 1236 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ACSL3O95573 720 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 FLT3P36888 993 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 RANBP1P43487 201 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ERVK-9P63128 1117 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 KCNJ2P63252 427 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 GJC1P36383 396 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 LMNTD2Q8IXW0 634 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 IQCKQ8N0W5 287 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 TSKSQ9UJT2 592 aa13.06□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 LRRD1A4D1F6 860 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 A8MUI8 341 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 LONP1P36776 959 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF131P52739 623 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 RFX8Q6ZV50 586 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 AGAP11Q8TF27 550 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 GLG1Q92896 1179 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 IFT74Q96LB3 600 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 TMBIM4Q9HC24 238 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 USH1CQ9Y6N9 552 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 EIF6P56537 245 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 MTMR3Q13615 1198 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 MUM1Q2TAK8 710 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 FAM83BQ5T0W9 1011 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 PPP4R3AQ6IN85 833 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 PRDM11Q9NQV5 511 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 TRPC6Q9Y210 931 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 BCS1LQ9Y276 419 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 C5P01031 1676 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 A0A087X0T9 212 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 UBOX5O94941 541 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 FAM228BP0C875 321 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CYP2D6P10635 497 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ACTN1P12814 892 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 FGFR4P22455 802 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 PLS1Q14651 629 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 MAN2A1Q16706 1144 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC24Q8N4L8 307 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 GJA10Q969M2 543 aa13.05□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 SHANK3Q9BYB0 1731 aa13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 MYH10P35580 1976 aa13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CYP27B1O15528 508 aa13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 STX2P32856 288 aa13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 TFAP4Q01664 338 aa13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF844Q08AG5 666 aa13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 ARHGAP44Q17R89 818 aa13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PRRX1-207ENST00000497230 RDH13Q8NBN7 331 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms