RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496332.5

THBS3-208, Transcript of thrombospondin 3, human

TSL 3

Gene THBS3, Length 839 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
THBS3-208	ENST00000496332	LGALS2	P05162	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PFKM	P08237	780 aa		13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	RFC2	P35250	354 aa		13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	SP4	Q02446	784 aa		13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	CAGE1	Q8TC20	777 aa		13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	CDHR1	Q96JP9	859 aa		13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		13.56	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	SCG2	P13521	617 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	KCNA2	P16389	499 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	DNAJB2	P25686	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PBX2	P40425	430 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	EVC	P57679	992 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PTK7	Q13308	1070 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	MTMR1	Q13613	665 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	HIC1	Q14526	733 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PHKB	Q93100	1093 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	JADE2	Q9NQC1	790 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	NID2	Q14112	1375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	ZBBX	A8MT70	800 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	SELP	P16109	830 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PKN1	Q16512	942 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PBX4	Q9BYU1	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	CDH23	Q9H251	3354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	MAFG	O15525	162 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	CKB	P12277	381 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	ACTN1	P12814	892 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	RBL2	Q08999	1139 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	NTRK3	Q16288	839 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	WNT8B	Q93098	351 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
THBS3-208	ENST00000496332	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	IFNAR1	P17181	557 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	SREBF1	P36956	1147 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	GPNMB	Q14956	572 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	RAB30	Q15771	203 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	CEP55	Q53EZ4	464 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	SERINC5	Q86VE9	423 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	MSRA	Q9UJ68	235 aa		13.52	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.51	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	MEIS1	O00470	390 aa		13.51	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.51	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	TREH	O43280	583 aa		13.51	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
THBS3-208	ENST00000496332	AR	P10275	920 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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