RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496277.5

CNIH3-211, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene CNIH3, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-211ENST00000496277 IPPKQ9H8X2 491 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.12□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SMARCA2P51531 1590 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 MAFKO60675 156 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 LRG1P02750 347 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 GNAT1P11488 350 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 COL6A2P12110 1019 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 NKX3-2P78367 333 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ADAM9Q13443 819 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TEPPQ6URK8 271 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 DPH6Q7L8W6 267 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 DNAJC7Q99615 494 aa6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 LTFP02788 710 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 NFIXQ14938 502 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TTLL6Q8N841 843 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 PTPRN2Q92932 1015 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ALG1Q9BT22 464 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 WASF3Q9UPY6 502 aa6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 AQP7O14520 342 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 GRIN1Q05586 938 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TUSC3Q13454 348 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 PRR31Q5SQ13 230 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 SOGA3Q5TF21 947 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 MKL1Q969V6 931 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 USP40Q9NVE5 1235 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.09□□□□□ -1.43
CNIH3-211ENST00000496277 RTP5Q14D33 572 aa6.08□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.08□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.08□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.08□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 RELTQ969Z4 430 aa6.08□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.08□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 DSEQ9UL01 958 aa6.08□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa6.08□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 NCAPD3P42695 1498 aa6.08□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 NOBOXO60393 691 aa6.07□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 GJA9P57773 515 aa6.07□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 GABREP78334 506 aa6.07□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 PAK1Q13153 545 aa6.07□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 PROSER1Q86XN7 944 aa6.07□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 TEPSINQ96N21 525 aa6.07□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 CD244Q9BZW8 370 aa6.07□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 HMGXB3Q12766 1538 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 ARVCFO00192 962 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 GUCY1A3Q02108 690 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 KCTD1Q719H9 257 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 JMYQ8N9B5 988 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 CLIC6Q96NY7 704 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 TMEM209Q96SK2 561 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.06□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 B8ZZF3 427 aa6.05□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 WNT9AO14904 365 aa6.05□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 CRTAMO95727 393 aa6.05□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 PYGMP11217 842 aa6.05□□□□□ -1.44
CNIH3-211ENST00000496277 FAHP16930 419 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms