RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.01■■□□□ 1.75
SENP6-211ENST00000493959 SPDYE3A6NKU9 549 aa26■■□□□ 1.75
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SENP6-211ENST00000493959 H3BRB1 525 aa26■■□□□ 1.75
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SENP6-211ENST00000493959 PPFIA3O75145 1194 aa26■■□□□ 1.75
SENP6-211ENST00000493959 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
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SENP6-211ENST00000493959 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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SENP6-211ENST00000493959 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.93■■□□□ 1.74
SENP6-211ENST00000493959 KAT6AQ92794 2004 aa25.93■■□□□ 1.74
SENP6-211ENST00000493959 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SENP6-211ENST00000493959 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SENP6-211ENST00000493959 FOSL2P15408 326 aa25.92■■□□□ 1.74
SENP6-211ENST00000493959 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
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