RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 POTEB3A0JP26 581 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 TREHO43280 583 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 CAND2O75155 1236 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 HOXC8P31273 242 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 POTEBQ6S5H4 581 aa24.19■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 ZBTB5O15062 677 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 CTSHP09668 335 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 CCND2P30279 289 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 ZP2Q05996 745 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 COL19A1Q14993 1142 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 IL31RAQ8NI17 732 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.18■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 KLRF2D3W0D1 207 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 NCK2O43639 380 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 LGALS2P05162 132 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 KRT23Q9C075 422 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 CLDND1Q9NY35 253 aa24.17■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 NOP56O00567 594 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 GNAT1P11488 350 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 MRE11P49959 708 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 ADHFE1Q8IWW8 467 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 APBB2Q92870 758 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 MTMR8Q96EF0 704 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 USP26Q9BXU7 913 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 KCNH6Q9H252 994 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 LAMA4Q16363 1823 aa24.16■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 NLRC5Q86WI3 1866 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 COL4A6Q14031 1691 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 C19orf67A6NJJ6 358 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 POLR2MP0CAP2 368 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 TRAF1Q13077 416 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 FCHSD1Q86WN1 690 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 IL17RAQ96F46 866 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 LNPKQ9C0E8 428 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.15■■□□□ 1.46
NELFE-210ENST00000491139 NHLH1Q02575 133 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 GNPTABQ3T906 1256 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 RPAINQ86UA6 219 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 FIBCD1Q8N539 461 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 FBXL18Q96ME1 805 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 SETD4Q9NVD3 440 aa24.14■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 RB1P06400 928 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 CTNNB1P35222 781 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 HOMER1Q86YM7 354 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.13■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 ZNF318Q5VUA4 2279 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 C5orf67F2Z3F1 127 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 LTBRP36941 435 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 NEDD9Q14511 834 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 METTL7BQ6UX53 244 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 LMAN2LQ9H0V9 348 aa24.12■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 IRS1P35568 1242 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 BMPR1AP36894 532 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 FAM26DQ5JW98 314 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 RWDD3Q9Y3V2 267 aa24.11■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 STAM2O75886 525 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 ICAM3P32942 547 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 ARHGAP4P98171 946 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 SEC23AQ15436 765 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 CTC1Q2NKJ3 1217 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 GPR20Q99678 358 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 KAT6AQ92794 2004 aa24.1■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 WDFY4Q6ZS81 3184 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 HIP1O00291 1037 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 GRM6O15303 877 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 ADAM17P78536 824 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 CLUL1Q15846 466 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 HFE2Q6ZVN8 426 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 TRIM50Q86XT4 487 aa24.09■■□□□ 1.45
NELFE-210ENST00000491139 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.09■■□□□ 1.45
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