RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486204.5

SSR4-211, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 658 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-211ENST00000486204 CDKL5O76039 1030 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 RGS20O76081 388 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 FDPSP14324 419 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PTGS1P23219 599 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ADCY7P51828 1080 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 VSIG10LQ86VR7 867 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.8□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 MYADML2A6NDP7 307 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 B4DLN1 442 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CTAGE5O15320 804 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ARIH2O95376 493 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 SMPD1P17405 629 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 NKX3-2P78367 333 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 NPY5RQ15761 445 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 STXBP2Q15833 593 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 HLA-CQ95604 372 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 TMEM260Q9NX78 707 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.79□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ST18O60284 1047 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 JAK2O60674 1132 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ASGR1P07306 291 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 TNFAIP2Q03169 654 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PGBD1Q96JS3 809 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 PIEZO1Q92508 2521 aa14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SSR4-211ENST00000486204 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CCND2P30279 289 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GJA9P57773 515 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 AP3B2Q13367 1082 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 TLK2Q86UE8 772 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 SCFD2Q8WU76 684 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ANO3Q9BYT9 981 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CERS4Q9HA82 394 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 C6orf50Q9HD87 102 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CD320Q9NPF0 282 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 MUC6Q6W4X9 2439 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 M0R2N6 131 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CD4P01730 458 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 NHLH1Q02575 133 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 SEMA3FQ13275 785 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 KRT40Q6A162 431 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 COPS5Q92905 334 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 UIMC1Q96RL1 719 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 HIPK3Q9H422 1215 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 SPC25Q9HBM1 224 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 Q9Y3F1 56 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 KAT6AQ92794 2004 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GBF1Q92538 1859 aa14.76□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 MYH15Q9Y2K3 1946 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ZBBXA8MT70 800 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 STAM2O75886 525 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 GNA11P29992 359 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 SREBF1P36956 1147 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 CCL23P55773 120 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.75□□□□□ -0.05
SSR4-211ENST00000486204 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms