RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MYH8P13535 1937 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 KLRF2D3W0D1 207 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CYTH3O43739 400 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TOM1O60784 492 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SLC8A1P32418 973 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MFSD14BQ5SR56 506 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 KDM7AQ6ZMT4 941 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MDM1Q8TC05 714 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB10Q96DT7 871 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 LRP5O75197 1615 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 VIMP08670 466 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ASIC1P78348 528 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ZBED6P86452 979 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 DTHD1Q6ZMT9 781 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC50Q8IVM0 306 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF25Q93038 417 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 HPS3Q969F9 1004 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SEC16BQ96JE7 1060 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 NOX5Q96PH1 765 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MYH6P13533 1939 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa17.81■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 IFNAR2P48551 515 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 EYA3Q99504 573 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MTA3Q9BTC8 594 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MXD3Q9BW11 206 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 AP1ARQ63HQ0 302 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM68Q6AZZ1 485 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MAEAQ7L5Y9 396 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF804AQ7Z570 1209 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC63Q8NA47 563 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 WDR66Q8TBY9 1149 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SCTRP47872 440 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 RCAN1P53805 252 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 PDE4DQ08499 809 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CRYMQ14894 314 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35G1Q2M3R5 365 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA20Q8TB22 786 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 OSBPL7Q9BZF2 842 aa17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 AP1M1Q9BXS5 423 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 DPH5Q9H2P9 285 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CEP104O60308 925 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 RASSF9O75901 435 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GRAPQ13588 217 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ARMC2Q8NEN0 867 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC7Q99615 494 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GOLPH3Q9H4A6 298 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 MAD2L2Q9UI95 211 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa17.79■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2IP78347 998 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 FAXDC2Q96IV6 333 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GPCPD1Q9NPB8 672 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 KCNK3O14649 394 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TECP42680 631 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 NOD2Q9HC29 1040 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 LEMD3Q9Y2U8 911 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CACNA1SQ13698 1873 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF263O14978 683 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 BMP15O95972 392 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 SCNN1DP51172 638 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 NID2Q14112 1375 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC170Q8IYT3 715 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 DUOX1Q9NRD9 1551 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC4BQ9NT99 713 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM260Q9NX78 707 aa17.78■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CALML3P27482 149 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 PRR5LQ6MZQ0 368 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 PIGSQ96S52 555 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CD209Q9NNX6 404 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHA6Q9UN73 950 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 CDK8P49336 464 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 GJA10Q969M2 543 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 COA7Q96BR5 231 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 NUP58Q9BVL2 599 aa17.77■□□□□ 0.44
CCSAP-204ENST00000483092 DOCK2Q92608 1830 aa17.77■□□□□ 0.43
CCSAP-204ENST00000483092 SMCO2A6NFE2 343 aa17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms