RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 CAGE1Q8TC20 777 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.28□□□□□ -0.92
CTPS1-209ENST00000480420 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 FIBPO43427 364 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TLL1O43897 1013 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PPFIA3O75145 1194 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 LGALS2P05162 132 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TGFB3P10600 412 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CPA1P15085 419 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 MARK3P27448 753 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF76P36508 570 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 RTN1Q16799 776 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ADCK5Q3MIX3 580 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM50Q86XT4 487 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 RASEFQ8IZ41 740 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 USP38Q8NB14 1042 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 IL27Q8NEV9 243 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 GLG1Q92896 1179 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PGBD1Q96JS3 809 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 UIMC1Q96RL1 719 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SETD4Q9NVD3 440 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 MEIS2O14770 477 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 UPP2O95045 317 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 F2P00734 622 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 RSPH10BP0C881 870 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 LIFRP42702 1097 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 IGBP1P78318 339 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGAP4P98171 946 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 APOBRQ0VD83 1088 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PTK7Q13308 1070 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 IKBKEQ14164 716 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 APOA5Q6Q788 366 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 WNT8BQ93098 351 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SLC9A7Q96T83 725 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 MAP3K14Q99558 947 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 EHMT1Q9H9B1 1298 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 PTPRSQ13332 1948 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TREHO43280 583 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 NBNO60934 754 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 STAM2O75886 525 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 GNAT1P11488 350 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SMARCA1P28370 1054 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ADCY7P51828 1080 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB103AP81534 67 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 GHRHRQ02643 423 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 MTMR1Q13613 665 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ADGRE1Q14246 886 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 KRT32Q14532 448 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 METTL7BQ6UX53 244 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZUG5 572 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SESTD1Q86VW0 696 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 VWCEQ96DN2 955 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 GPR20Q99678 358 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 MTA3Q9BTC8 594 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 USP26Q9BXU7 913 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM260Q9NX78 707 aa9.25□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 SMCO2A6NFE2 343 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 HAS3O00219 553 aa9.24□□□□□ -0.93
CTPS1-209ENST00000480420 ATP9AO75110 1047 aa9.24□□□□□ -0.93
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