RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	FBLN7	Q53RD9	439 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	MTFR1L	Q9H019	292 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	IFT22	Q9H7X7	185 aa		6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	HRK	O00198	91 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	GAS7	O60861	476 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	OCRL	Q01968	901 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	LSAMP	Q13449	338 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	ODR4	Q5SWX8	454 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC181	Q5TID7	509 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	FBXW5	Q969U6	566 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	KCTD3	Q9Y597	815 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		6.26	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	EYA4	O95677	639 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	SOD2	P04179	222 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	TACR1	P25103	407 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	EVA1C	P58658	441 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	FAP	Q12884	760 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF385B	Q569K4	471 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	TMC6	Q7Z403	805 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	C11orf74	Q86VG3	221 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC103	Q8IW40	242 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	IRAK3	Q9Y616	596 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	WNT9A	O14904	365 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	PYGM	P11217	842 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	LCP1	P13796	627 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	EPHB3	P54753	998 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	IL2	P60568	153 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	SSPN	Q14714	243 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CRY1	Q16526	586 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	RGL3	Q3MIN7	710 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	RPTN	Q6XPR3	784 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		6.24	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	C7orf72	A4D263	438 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	FAM83G	A6ND36	823 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541		H7BY64	318 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541		M0R2C6	588 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CBX4	O00257	560 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	RFXAP	O00287	272 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	N4BP3	O15049	544 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	GPR39	O43194	453 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	MSC	O60682	206 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	F2	P00734	622 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	KCNA6	P17658	529 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	PI3	P19957	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	GRK2	P25098	689 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	GRK3	P35626	688 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	DNM2	P50570	870 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	CDR1	P51861	262 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	NCKAP1L	P55160	1127 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	STAT4	Q14765	748 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	NR1I3	Q14994	352 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	INF2	Q27J81	1249 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.23	□□□□□ -1.41
RNF216-208	ENST00000479541	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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