RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa14.96□□□□□ -0.01
HPS1-211ENST00000478087 VCANP13611 3396 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 PITPNM1O00562 1244 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 FIBPO43427 364 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 REC8O95072 547 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 LGALS2P05162 132 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 CKBP12277 381 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 KRT32Q14532 448 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 GNPTABQ3T906 1256 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 BRF1Q92994 677 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 GPR20Q99678 358 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 TMEM260Q9NX78 707 aa14.95□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 TRANK1O15050 2925 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 WDR81Q562E7 1941 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 H3BRB1 525 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 STXBP3O00186 592 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 NBNO60934 754 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 STAM2O75886 525 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 NAPAP54920 295 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 BFSP2Q13515 415 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 METTL7BQ6UX53 244 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.94□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 TREHO43280 583 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SELPP16109 830 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 KCNA2P16389 499 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 RPS6KB1P23443 525 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 FGD1P98174 961 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 NEDD9Q14511 834 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 MBTPS1Q14703 1052 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 LRRC8DQ7L1W4 858 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SETD4Q9NVD3 440 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 MSRAQ9UJ68 235 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 EVPLQ92817 2033 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SMCO2A6NFE2 343 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF15O94989 841 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 FOSL2P15408 326 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 RFC2P35250 354 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 PTK7Q13308 1070 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 NLRX1Q86UT6 975 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 CAGE1Q8TC20 777 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 UIMC1Q96RL1 719 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SIP14410 1827 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 PFKMP08237 780 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 ARP10275 920 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.022e-7■■■□□ 14.6
HPS1-211ENST00000478087 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 RBL2Q08999 1139 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 ADGRE1Q14246 886 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 PKN1Q16512 942 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SPRED2Q7Z698 418 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 SERINC5Q86VE9 423 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 USP38Q8NB14 1042 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 PHKBQ93100 1093 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 GPRASP2Q96D09 838 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 USP26Q9BXU7 913 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 JADE2Q9NQC1 790 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 BARHL2Q9NY43 387 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 RFXAPO00287 272 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 ACTN1P12814 892 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 HOXC8P31273 242 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-211ENST00000478087 THPOP40225 353 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms