RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476467.1

PSMB4-204, Transcript of proteasome subunit beta 4, humanhuman

TSL 2

Gene PSMB4, Length 2,067 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4-204ENST00000476467 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TRIM17Q9Y577 477 aa14.92□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 LIG1P18858 919 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ME1P48163 572 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ACVR2BQ13705 512 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 RAET1EQ8TD07 263 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SCFD2Q8WU76 684 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 RIT2Q99578 217 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ADCY3O60266 1144 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TGFB3P10600 412 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 CYP2C19P33261 490 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TXKP42681 527 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TMEM266Q2M3C6 531 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TAPT1Q6NXT6 567 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 NFASCO94856 1347 aa14.91□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 CUTAO60888 179 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 PSMD10O75832 226 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 KCNA2P16389 499 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TTLL4Q14679 1199 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 GJA10Q969M2 543 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 UIMC1Q96RL1 719 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.9□□□□□ -0.02
PSMB4-204ENST00000476467 GAS7O60861 476 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 ATP9AO75110 1047 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 HMGCRP04035 888 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 IL17AQ16552 155 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 SDF4Q9BRK5 362 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 RAB34Q9BZG1 259 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 VAV3Q9UKW4 847 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 DHX15O43143 795 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 ARIH2O95376 493 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 ELNP15502 786 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 GRIN1Q05586 938 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 CLIC6Q96NY7 704 aa14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 TECP42680 631 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 NEDD9Q14511 834 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 AK8Q96MA6 479 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 CSRNP2Q9H175 543 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 NUP62CLQ9H1M0 184 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 CYBAP13498 195 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 LBX1P52954 281 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 KRT76Q01546 638 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 SP2Q02086 613 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 PPP2R5CQ13362 524 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 PDIA5Q14554 519 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 ADALQ6DHV7 355 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 IQSEC1Q6DN90 963 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.88□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.87□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 LY6KQ17RY6 165 aa14.87□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 UNC45AQ9H3U1 944 aa14.87□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 DACT1Q9NYF0 836 aa14.87□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 PTPN22Q9Y2R2 807 aa14.87□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 A0A1W2PQ27 194 aa14.86□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 A0A1W2PQ64 194 aa14.86□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 A0A1W2PQD8 194 aa14.86□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 POTEMA6NI47 508 aa14.86□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PSMB4-204ENST00000476467 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms