RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 LGR5O75473 907 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 DDAH1O94760 285 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 GJB5O95377 273 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 RSPH10BP0C881 870 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 SEMA3FQ13275 785 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 RAD9AQ99638 391 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 USP26Q9BXU7 913 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC69A6NI79 296 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 TREHO43280 583 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 FIBPO43427 364 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 EFCAB14O75071 495 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 SP4Q02446 784 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 AAK1Q2M2I8 961 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 METTL7BQ6UX53 244 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.2■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 MEIS2O14770 477 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 BMP1P13497 986 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 RXRAP19793 462 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 SMARCA1P28370 1054 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 MCM5P33992 734 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 TMTC2Q8N394 836 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 GPR20Q99678 358 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 SETD4Q9NVD3 440 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 EMSYQ7Z589 1322 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 LPXNO60711 386 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 GNAQP50148 359 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 KCNQ1P51787 676 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 TRIM50Q86XT4 487 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM87BQ96K49 555 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 MTA3Q9BTC8 594 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 TTC28Q96AY4 2481 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 SLC27A2O14975 620 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 CTSHP09668 335 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 NLRX1Q86UT6 975 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 LINC01553A4QN01 128 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 PIK3CDO00329 1044 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 AMHP03971 560 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 GNAT1P11488 350 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 HOXC8P31273 242 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 COG5Q9UP83 839 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.15■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 ERVK-21P61565 698 aa22.15■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.15■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 HLA-CQ95604 372 aa22.15■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.15■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 INSL6Q9Y581 213 aa22.15■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.15■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SHQ1-206ENST00000471526 CALM1P0DP23 149 aa22.14■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 CALM2P0DP24 149 aa22.14■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 CALM3P0DP25 149 aa22.14■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 LIFRP42702 1097 aa22.14■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGAP4P98171 946 aa22.14■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 SEPT8Q92599 483 aa22.14■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.14■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 ATP9AO75110 1047 aa22.13■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 NECTIN1Q15223 517 aa22.13■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 UBE2SQ16763 222 aa22.13■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.13■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.13■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 CAND2O75155 1236 aa22.12■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 UPP2O95045 317 aa22.12■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 FANCBQ8NB91 859 aa22.12■■□□□ 1.13
SHQ1-206ENST00000471526 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.12■■□□□ 1.13
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