RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466490.6

SRPRB-201, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SRPRB, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-201ENST00000466490 CEP72Q9P209 647 aa14.79□□□□□ -0.04
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SRPRB-201ENST00000466490 ERMARDQ5T6L9 678 aa14.79□□□□□ -0.04
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SRPRB-201ENST00000466490 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.78□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 CFAP73A6NFT4 308 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 BTNL10A8MVZ5 291 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 KCNK3O14649 394 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 ASAP2O43150 1006 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 KIF5BP33176 963 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 ITIH4Q14624 930 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 HLFQ16534 295 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 TXNRD1Q16881 649 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 KRT71Q3SY84 523 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 TLCD1Q96CP7 247 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 C15orf41Q9Y2V0 281 aa14.77□□□□□ -0.04
SRPRB-201ENST00000466490 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 CCDC188H7C350 402 aa14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 SNAP23O00161 211 aa14.77□□□□□ -0.05
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SRPRB-201ENST00000466490 INF2Q27J81 1249 aa14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 TBC1D5Q92609 795 aa14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 HPS3Q969F9 1004 aa14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 MYH4Q9Y623 1939 aa14.77□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 KIF4AO95239 1232 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 USP11P51784 963 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 MYO1EQ12965 1108 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 GALNT17Q6IS24 598 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 F8VZ95 297 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 FLT3P36888 993 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.76□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 CEP104O60308 925 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 NOL4O94818 638 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 ANP32DO95626 131 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 CHRNA2Q15822 529 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 FOXR2Q6PJQ5 311 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 UNC13DQ70J99 1090 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 A0A087X0T9 212 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 OR52Z1P0C646 297 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 FAM228BP0C875 321 aa14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
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