RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463601.1

TSC2-209, Transcript of TSC complex subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene TSC2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2-209ENST00000463601 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.19■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 NBNO60934 754 aa22.19■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 ICAM3P32942 547 aa22.19■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 RBL2Q08999 1139 aa22.19■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.19■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 FANCBQ8NB91 859 aa22.19■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.19■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 PIK3CDO00329 1044 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 ARHGEF15O94989 841 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 CA3P07451 260 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 IGFBP4P22692 258 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 RPS6KB1P23443 525 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 PSMA5P28066 241 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 GNAQP50148 359 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 PTK7Q13308 1070 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 GNPTABQ3T906 1256 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 MICU3Q86XE3 530 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 FBXL16Q8N461 479 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 SLC9A7Q96T83 725 aa22.18■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 LGALS2P05162 132 aa22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 MBTPS1Q14703 1052 aa22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 Q6ZUG5 572 aa22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 CUL5Q93034 780 aa22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 CERS4Q9HA82 394 aa22.17■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 RFXAPO00287 272 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 STAM2O75886 525 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 CXCL10P02778 98 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 UBE2SQ16763 222 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 METTL7BQ6UX53 244 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 GPR20Q99678 358 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.16■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 TTC28Q96AY4 2481 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 H3BRB1 525 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 ZBTB43O43298 467 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 FIBPO43427 364 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 BAIAP3O94812 1187 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 RCAN1P53805 252 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 SP4Q02446 784 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 NEDD9Q14511 834 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 RUFY3Q7L099 469 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 SPRED2Q7Z698 418 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 TRIM50Q86XT4 487 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
TSC2-209ENST00000463601 EPOPA6NHQ4 379 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 DEFB103AP81534 67 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 FGD1P98174 961 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 SERINC5Q86VE9 423 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 BRF1Q92994 677 aa22.14■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 KAT6AQ92794 2004 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 TREHO43280 583 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 ATP9AO75110 1047 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 HOXC8P31273 242 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 THPOP40225 353 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 KCNJ6P48051 423 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 TAP1Q03518 808 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 APOBRQ0VD83 1088 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.13■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 LCHNA4D1U4 455 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 ITGB5P18084 799 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 RTN1Q16799 776 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 XIRP2A4UGR9 3374 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 NID2Q14112 1375 aa22.12■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 SEC24BO95487 1268 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 EVCP57679 992 aa22.11■■□□□ 1.13
TSC2-209ENST00000463601 FUT2Q10981 343 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms