RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454225.1

CITED1-210, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene CITED1, Length 716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-210ENST00000454225 PDRG1Q9NUG6 133 aa29.57■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 TELO2Q9Y4R8 837 aa29.57■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 MTMR1Q13613 665 aa29.56■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 CTAGE1Q96RT6 745 aa29.56■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 GPR20Q99678 358 aa29.56■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 JADE2Q9NQC1 790 aa29.56■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 PKD2L1Q9P0L9 805 aa29.56■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 ATP9AO75110 1047 aa29.55■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 KCNA2P16389 499 aa29.55■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 IFNAR1P17181 557 aa29.55■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 AP3B2Q13367 1082 aa29.55■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 BFSP2Q13515 415 aa29.55■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 RETREG2Q8NC44 543 aa29.55■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 SCN5AQ14524 2016 aa29.54■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 H3BRB1 525 aa29.54■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 PITPNM1O00562 1244 aa29.54■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 FGBP02675 491 aa29.54■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 CLK2P49760 499 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa29.54■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 ESYT2A0FGR8 921 aa29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 RASIP1Q5U651 963 aa29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 OTOP2Q7RTS6 562 aa29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 DEFB128Q7Z7B8 93 aa29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 TRIM50Q86XT4 487 aa29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 HERVK_113Q902F9 699 aa29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 MXRA8Q9BRK3 442 aa29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 TANC1Q9C0D5 1861 aa29.53■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 IQCF3P0C7M6 154 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 SREBF1P36956 1147 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 STK3Q13188 491 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 ZNF697Q5TEC3 545 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 CCDC155Q8N6L0 562 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 CYP2W1Q8TAV3 490 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 CAGE1Q8TC20 777 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 VWCEQ96DN2 955 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 FAM161BQ96MY7 647 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 ZMYND12Q9H0C1 365 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 C6orf50Q9HD87 102 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 MTMR10Q9NXD2 777 aa29.52■■■□□ 2.32
CITED1-210ENST00000454225 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 ADAMTS3O15072 1205 aa29.51■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 CPLX1O14810 134 aa29.5■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 MAFGO15525 162 aa29.5■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 ANAPC15P60006 121 aa29.5■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 HIC1Q14526 733 aa29.5■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 KCNH7Q9NS40 1196 aa29.5■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 VPS54Q9P1Q0 977 aa29.5■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 PFKMP08237 780 aa29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 RFC2P35250 354 aa29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 ARHGAP4P98171 946 aa29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 CEP55Q53EZ4 464 aa29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 TRIM22Q8IYM9 498 aa29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 AFAP1L1Q8TED9 768 aa29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 C17orf102A2RUQ5 167 aa29.48■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 GRXCR1A8MXD5 290 aa29.48■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 GNA11P29992 359 aa29.48■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 ZNF76P36508 570 aa29.48■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 PTK7Q13308 1070 aa29.48■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 CCDC148Q8NFR7 591 aa29.48■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 ARP10275 920 aa29.47■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 LRRC8DQ7L1W4 858 aa29.47■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 RASGRP4Q8TDF6 673 aa29.47■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 SEPT1Q8WYJ6 367 aa29.47■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 WNT8BQ93098 351 aa29.47■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 TET1Q8NFU7 2136 aa29.47■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa29.46■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 ZBBXA8MT70 800 aa29.46■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 CKBP12277 381 aa29.46■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 SELPP16109 830 aa29.46■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 DNAJB2P25686 324 aa29.46■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 RBL2Q08999 1139 aa29.46■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 MEIS1O00470 390 aa29.45■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 MCTP2Q6DN12 878 aa29.45■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 BICD2Q8TD16 824 aa29.45■■■□□ 2.31
CITED1-210ENST00000454225 ATP6V0A1Q93050 837 aa29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms