RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SETQ01105 290 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 SEMA3FQ13275 785 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 LAMC2Q13753 1193 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 MCTP1Q6DN14 999 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF180Q86T96 592 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 NOSTRINQ8IVI9 506 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 OR6J1Q8NGC5 347 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 CYP2W1Q8TAV3 490 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNH7Q9NS40 1196 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 SZT2Q5T011 3432 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-205ENST00000450873 EDIL3O43854 480 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PGK1P00558 417 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 SYT1P21579 422 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 LETM2Q2VYF4 491 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM63BQ5T3F8 832 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 COPS5Q92905 334 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PHF24Q9UPV7 400 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MYH7BA7E2Y1 1941 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 ZEB2O60315 1214 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 ADAMTS4O75173 837 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 ARP10275 920 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 CST5P28325 142 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 SP2Q02086 613 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 Q4G0T1 1027 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR16Q569H4 304 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHDC9Q8NEP7 349 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MBOAT7Q96N66 472 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MLXIPQ9HAP2 919 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MTMR10Q9NXD2 777 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM205CA6NFA0 338 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 KIF28PB7ZC32 967 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 GGPS1O95749 300 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAPPC10P48553 1259 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 CPT1AP50416 773 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGAP1Q07960 439 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM60Q495X7 471 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 GNASQ5JWF2 1037 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MYSM1Q5VVJ2 828 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 Q7L0L9 218 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC17A8Q8NDX2 589 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP9AO75110 1047 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 NFASCO94856 1347 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNA2P16389 499 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL7BQ6UX53 244 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 SDF4Q9BRK5 362 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 CTAGE5O15320 804 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 STX6O43752 255 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 KPNA6O60684 536 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 TDP2O95551 362 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PTGS1P23219 599 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 CYFIP1Q7L576 1253 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 LENG9Q96B70 501 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 SPATA33Q96N06 139 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF577Q9BSK1 485 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PDLIM7Q9NR12 457 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 A6NJR5 290 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 RRP9O43818 475 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PPTC7Q8NI37 304 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 AFG1LQ8WV93 481 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 FERMT2Q96AC1 680 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MYADML2A6NDP7 307 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MSH4O15457 936 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP2B1P20020 1258 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 BEX3Q00994 111 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNA10Q16322 511 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 BRAPQ7Z569 592 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-205ENST00000450873 MTMR6Q9Y217 621 aa11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms