RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448446.2

TULP1-205, Transcript of tubby like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TULP1, Length 559 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1-205ENST00000448446 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 GPNMBQ14956 572 aa23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 SERINC5Q86VE9 423 aa23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 RAD9AQ99638 391 aa23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.02■■□□□ 1.28
TULP1-205ENST00000448446 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 AMHP03971 560 aa23.01■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.01■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 WNT8BQ93098 351 aa23.01■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.01■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 SLC27A2O14975 620 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 GJB5O95377 273 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 PLEKHA8P1O95397 391 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 RXRAP19793 462 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 RNF20Q5VTR2 975 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 CCDC82Q8N4S0 544 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 GPR20Q99678 358 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 RNPEPQ9H4A4 650 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 EPOPA6NHQ4 379 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 PIK3CDO00329 1044 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 TREHO43280 583 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 ARHGEF15O94989 841 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 GRB10Q13322 594 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 SEPT8Q92599 483 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 CDHR1Q96JP9 859 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 LCHNA4D1U4 455 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 LIFRP42702 1097 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 HIC1Q14526 733 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 SETD4Q9NVD3 440 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 COG5Q9UP83 839 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 INSL6Q9Y581 213 aa22.98■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 MEIS2O14770 477 aa22.97■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 CAND2O75155 1236 aa22.97■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 CTSHP09668 335 aa22.97■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 ARHGAP4P98171 946 aa22.97■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 TFF2Q03403 129 aa22.97■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 KRT40Q6A162 431 aa22.97■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.97■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 SEMA3FQ13275 785 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 MBTPS1Q14703 1052 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 TCTN1Q2MV58 587 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 MICU3Q86XE3 530 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 TRIM50Q86XT4 487 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 FANCBQ8NB91 859 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 GPRASP2Q96D09 838 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 TET1Q8NFU7 2136 aa22.96■■□□□ 1.27
TULP1-205ENST00000448446 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.95■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.95■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 HLA-CQ95604 372 aa22.95■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 NRCAMQ92823 1304 aa22.94■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 MTMR1Q13613 665 aa22.94■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 NECTIN1Q15223 517 aa22.94■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.94■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 GLG1Q92896 1179 aa22.94■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.94■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.94■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 LINC01553A4QN01 128 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 UPP2O95045 317 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 ERVK-21P61565 698 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 UBE2SQ16763 222 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 SPRED2Q7Z698 418 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 RSPH3Q86UC2 560 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 YME1L1Q96TA2 773 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 CHD9Q3L8U1 2897 aa22.93■■□□□ 1.26
TULP1-205ENST00000448446 HOXC8P31273 242 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms