RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439686.6

ARL6IP4-208, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, human

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene ARL6IP4, Length 796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		28.07	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HAS3	O00219	553 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MEIS1	O00470	390 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	28.06	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MFSD10	Q14728	455 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CEP55	Q53EZ4	464 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	UIMC1	Q96RL1	719 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	EDIL3	O43854	480 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	F2	P00734	622 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF76	P36508	570 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SHH	Q15465	462 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TDH	Q8IZJ6	230 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GTF3C6	Q969F1	213 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CDHR1	Q96JP9	859 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686		A0A1W2PPC1	479 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FAM86B1	E9PN63	330 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CDKL5	O76039	1030 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ST3GAL1	Q11201	340 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HIC1	Q14526	733 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NPY5R	Q15761	445 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MFSD5	Q6N075	450 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BICD2	Q8TD16	824 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	HIPK3	Q9H422	1215 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MAFG	O15525	162 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LGALS2	P05162	132 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CYP3A4	P08684	503 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CCL23	P55773	120 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TRIM50	Q86XT4	487 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CSF2RA	P15509	400 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	FPGS	Q05932	587 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SESTD1	Q86VW0	696 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	C7orf31	Q8N865	590 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ARL6IP4-208	ENST00000439686		H3BRB1	525 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	JAK2	O60674	1132 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PTGIS	Q16647	500 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	MCTP2	Q6DN12	878 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	BLID	Q8IZY5	108 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	STK36	Q9NRP7	1315 aa		28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LTBP2	Q14767	1821 aa		28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686		M0R2N6	131 aa		28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	ACR	P10323	421 aa		28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		28	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SCLY	Q96I15	445 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	LRCH3	Q96II8	777 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NOD1	Q9Y239	953 aa		27.98	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	VWCE	Q96DN2	955 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	NFASC	O94856	1347 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	CIITA	P33076	1130 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ARL6IP4-208	ENST00000439686	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.96	■■■□□ 2.07	2e-9	■■■□□ 16.5

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