RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 GTF3C6Q969F1 213 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 MYL10Q9BUA6 226 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 AMNQ9BXJ7 453 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 NID2Q14112 1375 aa14.31□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 KLRF2D3W0D1 207 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 OPLAHO14841 1288 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 BAIAP3O94812 1187 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 KCNQ1P51787 676 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 DEFB103AP81534 67 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 TROAPQ12815 778 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 CUL4AQ13619 759 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 SESTD1Q86VW0 696 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 NECAB1Q8N987 351 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.3□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 LCHNA4D1U4 455 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB5O15062 677 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 CKBP12277 381 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 RXRAP19793 462 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 HSD17B4P51659 736 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 ST3GAL1Q11201 340 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 SCRN1Q12765 414 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 LAMC2Q13753 1193 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 GPNMBQ14956 572 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 RTN1Q16799 776 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 TCTN1Q2MV58 587 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 IL31RAQ8NI17 732 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 PPTC7Q8NI37 304 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.29□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 XIRP2A4UGR9 3374 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 REV3LO60673 3130 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 NBNO60934 754 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 GGPS1O95749 300 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 F2P00734 622 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 COL9A1P20849 921 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 GRB10Q13322 594 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 FANCBQ8NB91 859 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 TET1Q8NFU7 2136 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 WNT8BQ93098 351 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 SPATA33Q96N06 139 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 PIGSQ96S52 555 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 MAP3K14Q99558 947 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 MAF1Q9H063 256 aa14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 TRANK1O15050 2925 aa14.27□□□□□ -0.12
PRAME-208ENST00000438888 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 RGS20O76081 388 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 KIF5BP33176 963 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 GRM4Q14833 912 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 PGM5Q15124 567 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SLC35G1Q2M3R5 365 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 MYH6P13533 1939 aa14.27□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CPLX1O14810 134 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 POLR2MP0CAP2 368 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 BMP1P13497 986 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CDC27P30260 824 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CCND2P30279 289 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 SP2Q02086 613 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 PTK7Q13308 1070 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 HIC1Q14526 733 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 AAK1Q2M2I8 961 aa14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PRAME-208ENST00000438888 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms