RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435871.1

ACTBP12-201, Transcript of actin, beta pseudogene 12, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP12, Length 418 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP12-201ENST00000435871 RTN1Q16799 776 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 TCTN1Q2MV58 587 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 METTL7BQ6UX53 244 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 CAGE1Q8TC20 777 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 USP26Q9BXU7 913 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 MSRAQ9UJ68 235 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa9.66□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 A0A0C4DFX4 3053 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 DLL1O00548 723 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 CXCL10P02778 98 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 ACTN1P12814 892 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 KCNA2P16389 499 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 HOXC8P31273 242 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 SP4Q02446 784 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 APOBRQ0VD83 1088 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 ADGRE1Q14246 886 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 MBTPS1Q14703 1052 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 Q6ZUG5 572 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 NLRX1Q86UT6 975 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 SERINC5Q86VE9 423 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 TRIM50Q86XT4 487 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 CYP2W1Q8TAV3 490 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 GPRASP2Q96D09 838 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 RIC8AQ9NPQ8 531 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.65□□□□□ -0.86
ACTBP12-201ENST00000435871 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 SMCO2A6NFE2 343 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 GOLGA8BA8MQT2 603 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 STXBP3O00186 592 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 ADAMTS3O15072 1205 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 TREHO43280 583 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 RCAN1P53805 252 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 NAPAP54920 295 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 FBXL16Q8N461 479 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 USP38Q8NB14 1042 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 BRF1Q92994 677 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 PGBD1Q96JS3 809 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 JADE2Q9NQC1 790 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 SETD4Q9NVD3 440 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 TMEM260Q9NX78 707 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 EYSQ5T1H1 3165 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 PTPRSQ13332 1948 aa9.64□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 ARHGEF15O94989 841 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 CA3P07451 260 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 RPS6KB1P23443 525 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 THPOP40225 353 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 ADAM17P78536 824 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 FGD1P98174 961 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 MTMR1Q13613 665 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 PKN1Q16512 942 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 CDHR1Q96JP9 859 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 SLC9A7Q96T83 725 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 BARHL2Q9NY43 387 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.63□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 RFXAPO00287 272 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 MAFGO15525 162 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 PPFIA3O75145 1194 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 BAIAP3O94812 1187 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 REC8O95072 547 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 RSPH10BP0C881 870 aa9.62□□□□□ -0.87
ACTBP12-201ENST00000435871 ARP10275 920 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms