RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434030.1

SEMA3B-205, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3B, Length 1,011 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-205ENST00000434030 BARHL2Q9NY43 387 aa25.39■■□□□ 1.66
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SEMA3B-205ENST00000434030 H3BRB1 525 aa25.38■■□□□ 1.65
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SEMA3B-205ENST00000434030 ITGB5P18084 799 aa25.38■■□□□ 1.65
SEMA3B-205ENST00000434030 RFC2P35250 354 aa25.38■■□□□ 1.65
SEMA3B-205ENST00000434030 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.38■■□□□ 1.65
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SEMA3B-205ENST00000434030 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa25.35■■□□□ 1.65
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SEMA3B-205ENST00000434030 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.34■■□□□ 1.65
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SEMA3B-205ENST00000434030 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.32■■□□□ 1.64
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SEMA3B-205ENST00000434030 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.32■■□□□ 1.64
SEMA3B-205ENST00000434030 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.32■■□□□ 1.64
SEMA3B-205ENST00000434030 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.32■■□□□ 1.64
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SEMA3B-205ENST00000434030 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.32■■□□□ 1.64
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SEMA3B-205ENST00000434030 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.31■■□□□ 1.64
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SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SEMA3B-205ENST00000434030 ESYT2A0FGR8 921 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-205ENST00000434030 TREHO43280 583 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-205ENST00000434030 NBNO60934 754 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-205ENST00000434030 PPFIA3O75145 1194 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-205ENST00000434030 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-205ENST00000434030 IFNAR1P17181 557 aa25.29■■□□□ 1.64
SEMA3B-205ENST00000434030 SREBF1P36956 1147 aa25.29■■□□□ 1.64
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