RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	LPXN	O60711	386 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	PPFIA4	O75335	1185 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	GGPS1	O95749	300 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	ICAM3	P32942	547 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	RASEF	Q8IZ41	740 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	FANCB	Q8NB91	859 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	PSEN2	P49810	448 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	CHMP4BP1	P59074	171 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	RBL2	Q08999	1139 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	SEMA3F	Q13275	785 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	GPNMB	Q14956	572 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA33	Q96N06	139 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF286B	P0CG31	522 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	SELP	P16109	830 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	MFSD10	Q14728	455 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	APOA5	Q6Q788	366 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	SPRED2	Q7Z698	418 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	MICU3	Q86XE3	530 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	CUL5	Q93034	780 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNB2	Q92953	911 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	LCHN	A4D1U4	455 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	FIBP	O43427	364 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	SORBS3	O60504	671 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPRS	Q13332	1948 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT32	Q14532	448 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	C7orf31	Q8N865	590 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	ALG1	Q9BT22	464 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		20.4	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	CXCL10	P02778	98 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	FUT2	Q10981	343 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	NEDD9	Q14511	834 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL7B	Q6UX53	244 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	RAD9A	Q99638	391 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		20.38	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXC8	P31273	242 aa		20.38	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB103A	P81534	67 aa		20.38	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	PTK7	Q13308	1070 aa		20.38	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	HIC1	Q14526	733 aa		20.38	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	20.38	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		20.38	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR37L1	O60883	481 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	NBN	O60934	754 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	GJB5	O95377	273 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	LGALS2	P05162	132 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	CKB	P12277	381 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	RCAN1	P53805	252 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-21	P61565	698 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	WNT8B	Q93098	351 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR20	Q99678	358 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	20.37	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738		H3BRB1	525 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB43	O43298	467 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	EFCAB14	O75071	495 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPA4	P34932	840 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	20.36	■□□□□ 0.85

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