RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 SEMA3FQ13275 785 aa26.64■■□□□ 1.86
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GLI3-202ENST00000428534 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa26.64■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 NR2E3Q9Y5X4 410 aa26.64■■□□□ 1.86
GLI3-202ENST00000428534 NFASCO94856 1347 aa26.64■■□□□ 1.85
GLI3-202ENST00000428534 MROH7Q68CQ1 1323 aa26.64■■□□□ 1.85
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GLI3-202ENST00000428534 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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GLI3-202ENST00000428534 SNX17Q15036 470 aa26.61■■□□□ 1.85
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GLI3-202ENST00000428534 Q4G0T1 1027 aa26.61■■□□□ 1.85
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GLI3-202ENST00000428534 ZNF577Q9BSK1 485 aa26.61■■□□□ 1.85
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GLI3-202ENST00000428534 ARP10275 920 aa26.6■■□□□ 1.85
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GLI3-202ENST00000428534 PKD2L1Q9P0L9 805 aa26.57■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
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GLI3-202ENST00000428534 SLC43A3Q8NBI5 491 aa26.56■■□□□ 1.84
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GLI3-202ENST00000428534 BAG4O95429 457 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa26.54■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 H3BRB1 525 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 MSH4O15457 936 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 EDIL3O43854 480 aa26.53■■□□□ 1.84
GLI3-202ENST00000428534 GAS7O60861 476 aa26.53■■□□□ 1.84
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