RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 SARSP49591 514 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ITGA1P56199 1179 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 GRIN1Q05586 938 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 FAM209AQ5JX71 171 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 EPB41L1Q9H4G0 881 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 GPR27Q9NS67 375 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 USP40Q9NVE5 1235 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM260Q9NX78 707 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 RTEL1Q9NZ71 1219 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 NTMQ9P121 344 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 MYOTQ9UBF9 498 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 WASF3Q9UPY6 502 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF652Q9Y2D9 606 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TRAF6Q9Y4K3 522 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 SH3D21A4FU49 640 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ENPP3O14638 875 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ADCY3O60266 1144 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TADA3O75528 432 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ASMTLO95671 621 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 LRG1P02750 347 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 FGFR1P11362 822 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 GRK2P25098 689 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 GRK3P35626 688 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ADAM9Q13443 819 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 SQSTM1Q13501 440 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 RTP5Q14D33 572 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TAF7LQ5H9L4 462 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TMC5Q6UXY8 1006 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 DHRS4Q9BTZ2 278 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 BDH2Q9BUT1 245 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 IPPKQ9H8X2 491 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 NOBOXO60393 691 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 APPP05067 770 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 HSD3B2P26439 372 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 CNR2P34972 360 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 GPR85P60893 370 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 NKX3-2P78367 333 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 CAP1Q01518 475 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TCEA2Q15560 299 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 CHRNA2Q15822 529 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 EMC4Q5J8M3 183 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 MCTP2Q6DN12 878 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 STYK1Q6J9G0 422 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TEPPQ6URK8 271 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 LBX2Q6XYB7 198 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TTLL7Q6ZT98 887 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 FRMD5Q7Z6J6 570 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 SCUBE1Q8IWY4 988 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 KYQ8NBH2 561 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 DCAF4Q8WV16 495 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 CLEC4DQ8WXI8 215 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 EXOC2Q96KP1 924 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 DTLQ9NZJ0 730 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 CROTQ9UKG9 612 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 TELO2Q9Y4R8 837 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SOD2P04179 222 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 GNAT1P11488 350 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SYN1P17600 705 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CANXP27824 592 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 GJA9P57773 515 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TUSC3Q13454 348 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 RGL3Q3MIN7 710 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 UBXN11Q5T124 520 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 C16orf86Q6ZW13 317 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 OTOP3Q7RTS5 596 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 IFNL3Q8IZI9 196 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 JMYQ8N9B5 988 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TEPSINQ96N21 525 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 FEZ1Q99689 392 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CD244Q9BZW8 370 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SLC6A20Q9NP91 592 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 CD2APQ9Y5K6 639 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-208ENST00000427110 KRIT1O00522 736 aa3.51□□□□□ -1.85
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