RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 TRIM50Q86XT4 487 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PIGOQ8TEQ8 1089 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 RILPQ96NA2 401 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SPC25Q9HBM1 224 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PASKQ96RG2 1323 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 COL15A1P39059 1388 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 DDIT3P35638 169 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 MTERF2Q49AM1 385 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 C21orf2O43822 256 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 MXI1P50539 228 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC63Q05C16 580 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC93Q567U6 631 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM179Q6ZVK1 233 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SH3GLB2Q9NR46 395 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 JRKLQ9Y4A0 524 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 MED14O60244 1454 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 USP14P54578 494 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM206Q9H813 350 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SMIM5Q71RC9 77 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 COX16Q9P0S2 106 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 MAPK4P31152 587 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PLTPP55058 493 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SEPT2Q15019 361 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CNGA1P29973 690 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 GIPC1O14908 333 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP2A3Q93084 1043 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR19Q8NEZ3 1342 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8IPA6NC78 632 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8JA6NMD2 632 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CRKP46108 304 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 IFNAR2P48551 515 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SNX1Q13596 522 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PSMD6Q15008 389 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 MASTLQ96GX5 879 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA8SH3BPF8 625 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC12A2P55011 1212 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 GABPAQ06546 454 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC151A5D8V7 595 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TTBK2Q6IQ55 1244 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF28PB7ZC32 967 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB5O15062 677 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR29P0C7W0 189 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 RXRBP28702 533 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC144BQ3MJ40 725 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 DPP9Q86TI2 863 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHL14Q9P2G3 628 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.71■□□□□ 0.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PP2D1A8MPX8 630 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 H7C0C1 242 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 SERPING1P05155 500 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 PHBP35232 272 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 PRCPP42785 496 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP5OP48047 213 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 CRB1P82279 1406 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 CLCN6P51797 869 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM260Q9NX78 707 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 FAN1Q9Y2M0 1017 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 CAPN7Q9Y6W3 813 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 USP17L10C9JJH3 530 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 FOXN1O15353 648 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 GMNNO75496 209 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 ABL1P00519 1130 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 SARNPP82979 210 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC17A8Q8NDX2 589 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 UNC13DQ70J99 1090 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 SGMS1Q86VZ5 419 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 PFDN4Q9NQP4 134 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 AKT3Q9Y243 479 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 GUCY1A2P33402 732 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 OSTNP61366 133 aa18.7■□□□□ 0.58
SH3BP4-202ENST00000392011 TXNRD1Q16881 649 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms