RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000388782.8

GKAP1-204, Transcript of G kinase anchoring protein 1, human

TSL 2

Gene GKAP1, Length 1,231 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GKAP1-204	ENST00000388782	ATP9A	O75110	1047 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	OR52Z1	P0C646	297 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	LAMC2	Q13753	1193 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	ANO1	Q5XXA6	986 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	SPC25	Q9HBM1	224 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	GAS7	O60861	476 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	MTMR9	Q96QG7	549 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		27.98	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	ARHGAP1	Q07960	439 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	PTGDR	Q13258	359 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	HAS1	Q92839	578 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	COPS5	Q92905	334 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	USP28	Q96RU2	1077 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	PRPH	P41219	470 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	GJA9	P57773	515 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	KRT76	Q01546	638 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	CFAP45	Q9UL16	551 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	CLIC4	Q9Y696	253 aa		27.96	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		27.95	■■■□□ 2.07
GKAP1-204	ENST00000388782	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	PSMD10	O75832	226 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC34A2	O95436	690 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	NKX3-2	P78367	333 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	LHX8	Q68G74	356 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	PPTC7	Q8NI37	304 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SPATA33	Q96N06	139 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	DEFB118	Q96PH6	123 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	GJB1	P08034	283 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	CPT1A	P50416	773 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	KRT85	P78386	507 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	UIMC1	Q96RL1	719 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	27.94	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	YEATS4	O95619	227 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	CAPN2	P17655	700 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	TXK	P42681	527 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		27.93	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	ELP1	O95163	1332 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SORBS3	O60504	671 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	ADAMTS4	O75173	837 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	PTGS1	P23219	599 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	PPP2R5C	Q13362	524 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	PTPA	Q15257	358 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	RNF180	Q86T96	592 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	AFG1L	Q8WV93	481 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	GJA10	Q969M2	543 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	VAV3	Q9UKW4	847 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	CENPF	P49454	3210 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782		A6NJR5	290 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	ZEB2	O60315	1214 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	PGK1	P00558	417 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SFN	P31947	248 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SP4	Q02446	784 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	SLC39A14	Q15043	492 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	STK38	Q15208	465 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	RDM1	Q8NG50	284 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GKAP1-204	ENST00000388782	RAB34	Q9BZG1	259 aa		27.91	■■■□□ 2.06

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