RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375227.8

LLGL2-202, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LLGL2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2-202ENST00000375227 WNT8BQ93098 351 aa25.46■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.46■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.46■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.46■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 SMCO2A6NFE2 343 aa25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 PITPNM1O00562 1244 aa25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 IQCF3P0C7M6 154 aa25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 PBX2P40425 430 aa25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 PHKBQ93100 1093 aa25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 GPRASP2Q96D09 838 aa25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
LLGL2-202ENST00000375227 TET1Q8NFU7 2136 aa25.45■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 KCNA2P16389 499 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 DNAJB2P25686 324 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 PKN1Q16512 942 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 ANO3Q9BYT9 981 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 SCG2P13521 617 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 BFSP2Q13515 415 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 NTRK3Q16288 839 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 RETREG2Q8NC44 543 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 PBX4Q9BYU1 374 aa25.44■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 H3BRB1 525 aa25.43■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 EVCP57679 992 aa25.43■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 MTMR1Q13613 665 aa25.43■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 JADE2Q9NQC1 790 aa25.43■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.43■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 GPNMBQ14956 572 aa25.42■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CAGE1Q8TC20 777 aa25.42■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.42■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 GBF1Q92538 1859 aa25.41■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 ZBBXA8MT70 800 aa25.41■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.41■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.41■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.41■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.41■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.41■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 PFKMP08237 780 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CKBP12277 381 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 RBL2Q08999 1139 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 PTK7Q13308 1070 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 TIFAQ96CG3 184 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CDHR1Q96JP9 859 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 SLC26A6Q9BXS9 759 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.4■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 EYSQ5T1H1 3165 aa25.39■■□□□ 1.66
LLGL2-202ENST00000375227 CHD9Q3L8U1 2897 aa25.39■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 SELPP16109 830 aa25.39■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 HOXC8P31273 242 aa25.39■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 RFC2P35250 354 aa25.39■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 SREBF1P36956 1147 aa25.39■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 AP3B2Q13367 1082 aa25.39■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.39■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 ARP10275 920 aa25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 IFNAR1P17181 557 aa25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 RABGGTBP53611 331 aa25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 MYLIPQ8WY64 445 aa25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa25.38■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.37■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 ESYT2A0FGR8 921 aa25.37■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 TREHO43280 583 aa25.37■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 NBNO60934 754 aa25.37■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 TCTN1Q2MV58 587 aa25.37■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.37■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 SERINC5Q86VE9 423 aa25.37■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 RASGRP4Q8TDF6 673 aa25.37■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
LLGL2-202ENST00000375227 SETD4Q9NVD3 440 aa25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms