RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 DDB1Q16531 1140 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TMOD1P28289 359 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PICK1Q9NRD5 415 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ABHD10Q9NUJ1 306 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CNBD1Q8NA66 436 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ANO9A1A5B4 782 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 OCA2Q04671 838 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KRT31Q15323 416 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 APOA5Q6Q788 366 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TNNC2P02585 160 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 LRRC63Q05C16 580 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SYCE1LA8MT33 242 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SYF2O95926 243 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MMS19Q96T76 1030 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PCGF5Q86SE9 256 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TTC25Q96NG3 672 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 NUDCD3Q8IVD9 361 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MID2Q9UJV3 735 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 GGA1Q9UJY5 639 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ADGRL2O95490 1459 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ATP10DQ9P241 1426 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM232C9JQI7 657 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 GSTA4O15217 222 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PSMD2Q13200 908 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 NT5C1BQ96P26 610 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ATP10BO94823 1461 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CTSWP56202 376 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.48□□□□□ -0.89
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PTPRT-204ENST00000373190 ECT2Q9H8V3 914 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MYH6P13533 1939 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ODR4Q5SWX8 454 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KLC3Q6P597 504 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 BATF3Q9NR55 127 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RASA4BC9J798 803 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 RASA4O43374 803 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 GFPT2O94808 682 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PYGBP11216 843 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SESTD1Q86VW0 696 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.47□□□□□ -0.89
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PTPRT-204ENST00000373190 KCTD6Q8NC69 237 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PPME1Q9Y570 386 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 MMP1P03956 469 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CYP2C19P33261 490 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CYP27A1Q02318 531 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CAV1Q03135 178 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 CFLARO15519 480 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SRGAP2O75044 1071 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 PDIK1LQ8N165 341 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ARID5BQ14865 1188 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 XKR9Q5GH70 373 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 FSCBQ5H9T9 825 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 ANO5Q75V66 913 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-204ENST00000373190 KRT37O76014 449 aa9.47□□□□□ -0.89
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