RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF3Q9H094 633 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 GFPT2O94808 682 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFA10O95299 355 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 INHBAP08476 426 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 AP3B2Q13367 1082 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 BIRC2Q13490 618 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 HINFPQ9BQA5 517 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 TXNDC9O14530 226 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SERPING1P05155 500 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC8CQ8TDW0 803 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 WDR70Q9NW82 654 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.99■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 IRX4P78413 519 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 RFX6Q8HWS3 928 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SGO2Q562F6 1265 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PBKQ96KB5 322 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 BHMT2Q9H2M3 363 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 COX16Q9P0S2 106 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 HIP1RO75146 1068 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PSAPP07602 524 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 BRINP3Q76B58 766 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SGK1O00141 431 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 MMP10P09238 476 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PLCB4Q15147 1175 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 MASTLQ96GX5 879 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 KDM6BO15054 1643 aa21.98■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PDE1BQ01064 536 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 MTERF2Q49AM1 385 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PDXDC2PQ6P474 469 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SCYL1Q96KG9 808 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 STK36Q9NRP7 1315 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC151A5D8V7 595 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 GSTA1P08263 222 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 GSTA2P09210 222 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 RCAN1P53805 252 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT6Q14141 434 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ABI1Q8IZP0 508 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 BBS5Q8N3I7 341 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 NARFQ9UHQ1 456 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ECEL1O95672 775 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SURF1Q15526 300 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PTPN21Q16825 1174 aa21.97■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 MED7O43513 233 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 IL9RQ01113 521 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PRPSAP1Q14558 356 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 TTLL6Q8N841 843 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SNX25Q9H3E2 840 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SOWAHDA6NJG2 315 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 NXNQ6DKJ4 435 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2R1Q13018 1463 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PRDX5P30044 214 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 PLTPP55058 493 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD16Q68DU8 428 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.96■■□□□ 1.11
CCSAP-203ENST00000366687 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 RESP18Q5W5W9 173 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 EFCC1Q9HA90 598 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 ATP1A3P13637 1013 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 SUN1O94901 812 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 KRT31Q15323 416 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF4Q8WV16 495 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 GH2P01242 217 aa21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CCSAP-203ENST00000366687 FTCDO95954 541 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms