RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 PSEN2P49810 448 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 NLRP5P59047 1200 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 NPY5RQ15761 445 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 GPR20Q99678 358 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.05■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 FAM86B1E9PN63 330 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 HAS3O00219 553 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 TIMP1P01033 207 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS2P05162 132 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 FAM86B2P0C5J1 330 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 ARP10275 920 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CYP2C9P11712 490 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 MFSD10Q14728 455 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CEP55Q53EZ4 464 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 BICD2Q8TD16 824 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CDHR1Q96JP9 859 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 C16orf70Q9BSU1 422 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 ALG1Q9BT22 464 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 KCNH7Q9NS40 1196 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 GJB4Q9NTQ9 266 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 KCNJ14Q9UNX9 436 aa17.04■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 NOP56O00567 594 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 EDIL3O43854 480 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 JAK2O60674 1132 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 PPFIA4O75335 1185 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CYP3A4P08684 503 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 FDPSP14324 419 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CYP2C18P33260 490 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 EPHB4P54760 987 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA0753Q2KHM9 967 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM50Q86XT4 487 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 TDHQ8IZJ6 230 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.03■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PPC1 479 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 M0R2N6 131 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 MEIS1O00470 390 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 HIC1Q14526 733 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf50Q5SZB4 431 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 MFSD5Q6N075 450 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 SESTD1Q86VW0 696 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 DAGLBQ8NCG7 672 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 CTAGE1Q96RT6 745 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 KATNAL1Q9BW62 490 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 HIPK3Q9H422 1215 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 HDAC6Q9UBN7 1215 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa17.02■□□□□ 0.32
CSAG1-201ENST00000361211 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 MAFGO15525 162 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF76P36508 570 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 FPGSQ05932 587 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 MCTP2Q6DN12 878 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 PLA2G4DQ86XP0 818 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 BLIDQ8IZY5 108 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 UIMC1Q96RL1 719 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 PHF20Q9BVI0 1012 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 WNT8AQ9H1J5 351 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 LAMA3Q16787 3333 aa17.01■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 H3BRB1 525 aa17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 CSF2RAP15509 400 aa17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 CCL23P55773 120 aa17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 SHHQ15465 462 aa17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 NIPA1Q7RTP0 329 aa17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC83Q8IWF9 413 aa17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 C7orf31Q8N865 590 aa17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 NFASCO94856 1347 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 CIITAP33076 1130 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 FOSBP53539 338 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 PTGISQ16647 500 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 OXER1Q8TDS5 423 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 TBCKQ8TEA7 893 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 LENG9Q96B70 501 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 SCLYQ96I15 445 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 SLC9A2Q9UBY0 812 aa16.99■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms